Zpět na hledáníUnraveling a FNR-based regulatory circuit in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomic and bioinformatic approaches (2009)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/09:00029725 |
|---|---|
| Název v původním jazyce | Unraveling a FNR-based regulatory circuit in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomic and bioinformatic approaches |
| Název v anglickém jazyce | Unraveling a FNR-based regulatory circuit in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomic and bioinformatic approaches |
| Druh | O - Ostatní výsledky, které nelze zařadit do žádného z definovaných druhů výsledků |
| Jazyk | cze - čeština |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CE - Biochemie |
| Rok uplatnění | 2009 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 7 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Pavel Bouchal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2503786) Eva Budinská (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3818780) Igor Kučera (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3087719) Iva Struhárová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2474115) Ondrej Šedo (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9410139) Tereza Vyhlídalová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5589622) Zbyněk Zdráhal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4568567) Rob van Spanning (státní příslušnost: NL - Nizozemsko) |
| Popis výsledku v původním jazyce | The switch from aerobic to anaerobic respiration in the bacterium Paracoccus denitrificans is orchestrated by the action of three Fnr-type transcription regulators FnrP, NNR and NarR, which are sensors for oxygen, nitric oxide and nitrite, respectively.In this study, we aimed to discover the role of Fnr-family transcription regulators in the aerobic-semiaerobic switch at global level. Methods and Materials: We analyzed the protein composition of four Paracoccus denitrificans strains (wild type, FnrP-,NNRand NarR- mutant strains) grown aerobically, semiaerobically and semiearobically in the presence of nitrate using two-dimensional gel electropohoresis with MS/MS protein identification, with data validation at the transcript (qRT-PCR) and genome (FNR-binding sequences) levels. Results: Expression profiles were acquired using two-dimensional gel electrophoresis for 737 protein spots, in which 640 proteins gene products were identified using mass spectrometry. |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The switch from aerobic to anaerobic respiration in the bacterium Paracoccus denitrificans is orchestrated by the action of three Fnr-type transcription regulators FnrP, NNR and NarR, which are sensors for oxygen, nitric oxide and nitrite, respectively.In this study, we aimed to discover the role of Fnr-family transcription regulators in the aerobic-semiaerobic switch at global level. Methods and Materials: We analyzed the protein composition of four Paracoccus denitrificans strains (wild type, FnrP-,NNRand NarR- mutant strains) grown aerobically, semiaerobically and semiearobically in the presence of nitrate using two-dimensional gel electropohoresis with MS/MS protein identification, with data validation at the transcript (qRT-PCR) and genome (FNR-binding sequences) levels. Results: Expression profiles were acquired using two-dimensional gel electrophoresis for 737 protein spots, in which 640 proteins gene products were identified using mass spectrometry. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | proteome Paracoccus denitrificans |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/09:00029725!RIV10-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 21.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 11820329 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2010 | RIV/00216224:14310/09:00029725 v dodávce dat RIV10-GA0-14310___/01:1 |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2011 | RIV/00216224:14310/09:00029725 v dodávce dat RIV11-GA0-14310___/01:1 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |
|---|