Zpět na hledáníGeneral Base Catalysis for Cleavage by the Active-Site Cytosine of the Hepatitis Delta Virus Ribozyme: QM/MM Calculations Establish Chemical Feasibility (2008)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/08:00026551 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | General Base Catalysis for Cleavage by the Active-Site Cytosine of the Hepatitis Delta Virus Ribozyme: QM/MM Calculations Establish Chemical Feasibility |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2008 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 9 |
| Počet tvůrců celkem | 7 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779) Pavel Banas (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Veronika Hanosova (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Michal Otyepka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Lubomir Rulisek (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Daniel Svozil (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Nils Walter (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Investigation of active-site nucleotide C75 role in self-cleavage of HDVr. For this purpose quantum chemical/molecular mechanical calculations were carried out. Calculations show that C75 is readily capable of acting as the general base, in concert withthe hydrated magnesium ion as the general acid. The calculated energy barrier of the proposed mechanism, minus 20 kcal/mol, would lower the reaction barrier by minus15 kcal/mol compared with the uncatalyzed reaction and is in good agreement with experimental data. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | quantum chemistry; molecular mechanical calculation; HDVr |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Physical Chemistry B |
|---|---|
| ISSN | 1520-6106 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 112 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 35 |
| Stát vydavatele periodika | CZ - Česká republika |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000258800300054 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/08:00026551!RIV10-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 21.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 11791302 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2009 | RIV/68081707:_____/08:00313367 v dodávce dat RIV09-AV0-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2009 | RIV/61989592:15310/08:00005452 v dodávce dat RIV09-AV0-15310___/01:1 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno AV ČR v roce 2009 | RIV/61388963:_____/08:00313367 v dodávce dat RIV09-AV0-61388963/01:1 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2009 | RIV/68081707:_____/08:00313367 v dodávce dat RIV09-MSM-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2009 | RIV/61989592:15310/08:00005452 v dodávce dat RIV09-MSM-15310___/01:1 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2009 | RIV/61388963:_____/08:00313367 v dodávce dat RIV09-MSM-61388963/01:1 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/60461373:22310/08:00020618 v dodávce dat RIV10-MSM-22310___/01:1 předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemické technologie |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LC | LC06030 - Biomolekulární centrum (2006 - 2010) |
|---|---|
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |