Zpět na hledáníGeometrical and Electronic Structure Variability of the Sugar-phosphate Backbone in Nucleic Acids (2008)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/08:00026550 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Geometrical and Electronic Structure Variability of the Sugar-phosphate Backbone in Nucleic Acids |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2008 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 7 |
| Počet tvůrců celkem | 9 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779) Ferda Forti (státní příslušnost: ES - Španělské království) Thomas Cheatham (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) Javier Luque (státní příslušnost: ES - Španělské království) Ivan Marchan (státní příslušnost: ES - Španělské království) Modesto Orozco (státní příslušnost: ES - Španělské království) Alberto Perez (státní příslušnost: ES - Španělské království) Judit Sponer (státní příslušnost: HU - Maďarsko) Daniel Svozil (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Quantum chemistry was used to describe alpha/gamma energetics and to access Amber force field parm99 and parmbsc0. This was tested on two models systems: SPM consisting of a sugar and methyl group linked through a phosphodiester bond and SPSOM consistingof two deoxyribose residues (without the bases) connected via a phosphodiester bond. A comparison of the ab initio data with the ff99 potential energy surface clearly reveals an incorrect ff99 force-field description in the regions where the gamma torsion is in the trans conformation. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Molecular dynamics; force field; quantum chemistry; nucleic acids |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Physical Chemistry B |
|---|---|
| ISSN | 1520-6106 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 112 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 27 |
| Stát vydavatele periodika | CZ - Česká republika |
| Počet stran výsledku | 10 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000257335200031 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/08:00026550!RIV10-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 21.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 11791276 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2009 | RIV/68081707:_____/08:00310366 v dodávce dat RIV09-AV0-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2009 | RIV/61388963:_____/08:00310366 v dodávce dat RIV09-AV0-61388963/01:1 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2009 | RIV/68081707:_____/08:00310366 v dodávce dat RIV09-MSM-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2009 | RIV/61388963:_____/08:00310366 v dodávce dat RIV09-MSM-61388963/01:1 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/60461373:22310/08:00020617 v dodávce dat RIV10-MSM-22310___/01:1 předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemické technologie |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |
|---|