Identifikační kód |
RIV/00216224:14310/07:00022384 |
Název v anglickém jazyce |
Identification of Tunnels in Proteins, Nucleic Acids, Inorganic Materials and Molecular Ensembles |
Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
Poddruh |
- |
Jazyk |
eng - angličtina |
Obor - skupina |
D - Vědy o zemi |
Obor |
DB - Geologie a mineralogie |
Rok uplatnění |
2007 |
Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku |
8 |
Počet tvůrců celkem |
4 |
Počet domácích tvůrců |
2 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Jiří Damborský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1030175) Martin Petřek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7467370) Pavel Banáš (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Michal Otyepka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
Popis výsledku v anglickém jazyce |
he knowledge of the access paths connecting interior of molecular systems with surrounding environment is important for understanding of structure-function relationships and engineering of molecules for biotechnological applications. CAVER is a computerprogram developed for calculations of tunnels, channels or pores in the biomolecules, inorganic materials and molecular ensembles. The algorithm performs a skeleton search based on a reciprocal distance function grid. The algorithm is implemented in thestand-alone version, web version and as plug-in for PyMol. CAVER is available from the web site http://loschmidt.chemi.muni.cz/caver. |
Klíčová slova oddělená středníkem |
structure-function relationships; CAVER; calculations of tunnels |
Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
Odkaz na údaje z výzkumu |
- |