Zpět na hledáníShape-specific recognition in the structure of the Vts1p SAM domain with RNA (2006)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/06:00018474 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Shape-specific recognition in the structure of the Vts1p SAM domain with RNA |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CE - Biochemie |
| Rok uplatnění | 2006 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Richard Štefl (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6439608) Frederic Allain (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Guillaume Chanfreau (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Michael Janis (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) Albert Lee (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) Florian Oberstrass (státní příslušnost: CH - Švýcarská konfederace) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Although the abundant sterile alpha motif (SAM) domain was originally classified as a protein-protein interaction domain, it has recently been shown that certain SAM domains have the ability to bind RNA, defining a new type of post-transcriptional gene regulator. To further understand the function of SAM-RNA recognition, we determined the solution structures of the SAM domain of the Saccharomyces cerevisiae Vts1p (Vts1p-SAM) and the Smaug response element (SRE) stem-loop RNA as a complex and in isolation. The structures show that Vts1p-SAM recognizes predominantly the shape of the SRE rather than its sequence, with the exception of a G located at the tip of the pentaloop. Using microarray gene profiling, we identified several genes in S. cerevisiae that seem to be regulated by Vts1p and contain one or more copies of the SRE. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; REPRESSES TRANSLATION; DEADENYLASE COMPLEX; DROSOPHILA EMBRYO; DIPOLAR COUPLINGS; CRYSTAL-STRUCTURE; CCR4-NOT COMPLEX; GENE-EXPRESSION |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY |
|---|---|
| ISSN | 1545-9985 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 13 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 2 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 8 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/06:00018474!RIV10-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 21.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 11763767 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |
|---|