Zpět na hledáníThe Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution (2006)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/06:00017450 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CE - Biochemie |
| Rok uplatnění | 2006 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 9 |
| Počet domácích tvůrců | 6 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jiří Damborský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1030175) Andrea Jesenská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9123377) Martin Klvaňa (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3986489) Hana Konečná (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9725741) Martina Pavlová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9072500) Zbyněk Prokop (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3599019) Yuji Nagata (státní příslušnost: JP - Japonsko) T. Sato (státní příslušnost: JP - Japonsko) M. Tsuda (státní příslušnost: JP - Japonsko) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85 showed poor expression and low stability when produced in Escherichia coli. Here we present expression DhmA in newly constructed pK4RP rhodococcal expression system in a soluble and stable form. Site-directed mutagenesis was used for the identification of a catalytic pentad, which makes up the reaction machinery of all currently known haloalkane dehalogenases. The putative catalytic triad Asp123, His279, Asp250 and the first halide-stabilizing residue Trp124 were deduced from sequence comparisons. The second stabilizing residue Trp164 was predicted from a homology model. Five point mutants in the catalytic pentad were constructed, tested for activity and were found inactive. A two-step reactionmechanism was proposed for DhmA. Evolution of different types of catalytic pentads and molecular adaptation towards the synthetic substrate 1,2-dichloroethane within the protein family is discussed. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Haloalkane dehalogenase DhmA; Mycobacterium avium N85; expression; Site-directed mutagenesis |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY |
|---|---|
| ISSN | - |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 1/2006 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 1 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 9 |
| Strana od-do | 9999 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2007 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/06:00017450!RIV07-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 24.07.2007 |
| Kontrolní číslo | 10345681 |