Zpět na hledáníThree-Bond Sugar-Base Couplings in Purine versus Pyrimidine Nucleosides: A DFT Study of Karplus Relationships for 3JC2/4-H1' and 3JC6/8-H1' in DNA (2006)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/06:00016826 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Three-Bond Sugar-Base Couplings in Purine versus Pyrimidine Nucleosides: A DFT Study of Karplus Relationships for 3JC2/4-H1' and 3JC6/8-H1' in DNA |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Rok uplatnění | 2006 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Markéta Munzarová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1962604) Vladimír Sklenář (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3906884) Wolfgang Bermel (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) Mirko Hennig (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) Lincol G. Scott (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) James R. Williamson (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Long range scalar 5J(H1',F) couplings were observed in 5-fluoropyrimidine substituted RNA. We developed a novel S3E-19F-Ń,Ň-edited NOESY experiment for quantitation of these long range scalar 5J(H1',F), where the J-couplings can be extracted from inspection of intraresidual (H1',H6) NOE crosspeaks. The 5J(H1',F) couplings can be used to restrict the glycosidic torsion angle Ó which defines the orientation of the base with respect to the ribose sugar moiety. Quantum chemical calculations were exploited to investigate the relation between scalar couplings and conformations around the glycosidic bond in oligonucleotides. The theoretical dependence of the observed 5J(H1',F) couplings on the torsion angle Ó can be described by a generalized Karplus relationship. The corresponding density functional theory (DFT) analysis is outlined. Additional NMR experiments facilitating the resonance assignments of 5-fluoropyrimidine substituted RNAs are described and chemical shift changes due to altered |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Scalar Coupling Constants; Fluorine; 5-Fluorouridine; 5-Fluorocytidine; HIV-TAR RNA |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of the American Chemical Society |
|---|---|
| ISSN | 0002-7863 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 128 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 17 |
| Stát vydavatele periodika | CZ - Česká republika |
| Počet stran výsledku | 8 |
| Strana od-do | 5851-5858 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2008 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/06:00016826!RIV08-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 29.08.2008 |
| Kontrolní číslo | 10746923 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |
|---|