Zpět na hledáníHigh affinity fucose binding of Pseudomonas aeruginosa lectin PA-IIL: 1.0 A resolution crystal structure of the complex combined with thermodynamics and computational chemistry approaches (2005)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/05:00013567 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | High affinity fucose binding of Pseudomonas aeruginosa lectin PA-IIL: 1.0 A resolution crystal structure of the complex combined with thermodynamics and computational chemistry approaches |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CE - Biochemie |
| Rok uplatnění | 2005 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 11 |
| Počet domácích tvůrců | 5 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Ctirad Hofr (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9914048) Jaroslav Koča (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4347374) Martina Pokorná (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5616697) Lenka Šnajdrová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1139002) Michaela Wimmerová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5522064) Catherine Gautier (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Nechama Gilboa-Garber (státní příslušnost: IL - Stát Izrael) Anne Imberty (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Edward Mitchell (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Stephanie Perret (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Charles Sabin (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | PA-IIL is a fucose-binding lectin from Pseudomonas aeruginosa that is closely related to the virulence factors of the bacterium. Previous structural studies have revealed a new carbohydrate-binding mode with direct involvement of two calcium ions (Mitchell E, Houles C, Sudakevitz D, Wimmerova M, Gautier C, Perez S,Wu AM, Gilboa-Garber N Imberty A. Structural basis for selective recognition of oligosaccharides from cystic fibrosis patients by the lectin PA-IIL of Pseudomonas aeruginosa. Nat Struct Biol 2002;9:918921). A combination of thermodynamic, structural, and computational methods has been used to study the basis of the high affinity for the monosaccharide ligand. A titration microcalorimetry study indicated that the high affinity is enthalpy driven. The crystal structure of the tetrameric PA-IIL in complex with fucose and calcium was refined to 1.0 Ĺ resolution and, in combination with modeling, allowed a proposal to be made for the hydrogen-bond network in the binding site. Calc |
| Klíčová slova oddělená středníkem | lectin; Pseudomonas aeruginosa; cystic fibrosis; crystal structure |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics |
|---|---|
| ISSN | 0887-3585 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 58 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 3 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 12 |
| Strana od-do | 735-746 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2006 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/05:00013567!RIV06-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 23.06.2006 |
| Kontrolní číslo | 10052174 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2011 | RIV/68081707:_____/05:00345103 v dodávce dat RIV11-AV0-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2011 | RIV/68081707:_____/05:00345103 v dodávce dat RIV11-GA0-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LN | LN00A016 - BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM (2000 - 2004) |
|---|---|
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |