Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216208:11310/21:10428478 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Carborane- or Metallacarborane-Linked Nucleotides for Redox Labeling. Orthogonal Multipotential Coding of all Four DNA Bases for Electrochemical Analysis and Sequencing |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10401 - Organic chemistry |
| Rok uplatnění | 2021 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 12 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Michal Hocek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6659160, orcid: 0000-0002-1113-2047, scopusid: 7003609711, researcherid: A-9665-2008) Anna Simonova (státní příslušnost: RU - Ruská federace, domácí tvůrce: A, vedidk: 8147380) Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Luděk Havran (státní příslušnost: CZ - Česká republika) David Kodr (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0002-5948-6426) Zbigniew J. Lesnikowski (státní příslušnost: PL - Polská republika, orcid: 0000-0003-3158-5796) Ciara Kathleen O'Sullivan (státní příslušnost: ES - Španělské království, orcid: 0000-0003-2603-2230) Mayreli Ortiz (státní příslušnost: ES - Španělské království, orcid: 0000-0002-9423-0055) Radek Pohl (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0001-7898-946X) Dijana Pavlović Saftić (státní příslušnost: PL - Polská republika) Veronika Sýkorová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Cansu Pinar Yenice (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We report a series of 2'-deoxyribonucleoside triphosphates bearing dicarba-nido-undecaborate ([C2B9H11](1-)), [3,3'-iron-bis(1,2-dicarbollide)](-) (FESAN, [Fe(C2B9H11)(2)](2-)) or [3,3'-cobalt-bis(1,2-dicarbollide)](-) (COSAN, [Co(C2B9H11)(2)](2-)) groups prepared either through the Sonogashira cross-coupling or the CuAAC click reaction. The modified dN(X)TPs were substrates for KOD XL DNA polymerase in enzymatic synthesis of modified DNA through primer extension (PEX). The nido-carborane- and FESAN-modified nucleotides gave analytically useful oxidation signals in square-wave voltammetry and were used for redox labeling of DNA. The redox-modified DNA probes were prepared by PEX using tailed primers and were hybridized to electrode (gold or glassy carbon) containing capture oligonucleotides. The combination of nido-carborane- and FESAN-linked nucleotides with 7-ferrocenylethynyl-7-deaza-dATP and 7-deaza-dGTP allowed polymerase synthesis of DNA fully modified at all four nucleobases, and each of the redox labels gave four differentiable and ratiometric signals in voltammetry. Thus, the combination of these four redox labels constitutes the first fully orthogonal redox coding of all four canonical nucleobases, which can be used for determination of nucleobase composition of short DNA stretches in one simple PEX experiment with electrochemical readout. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | aptamers;surfaces;chemistry;challenges;derivatives;carbaboranes;amplification;sensors;nucleoside triphosphates;neutron-capture therapy |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=Qmota_zIO6 |
| DOI výsledku | https://doi.org/10.1021/jacs.1c02222 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of the American Chemical Society |
|---|---|
| ISSN | 0002-7863 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 143 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 18 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | 7124-7134 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000651748000044 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85106466637 |
| Způsob publikování výsledku | C - Omezený přístup (Restricted Access) |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2022 |
| Specifikace | RIV/00216208:11310/21:10428478!RIV22-MSM-11310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 20.05.2022 |
| Kontrolní číslo | 192392679 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2022 | RIV/68081707:_____/21:00542459 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2022 | RIV/61388963:_____/21:00542459 v dodávce dat RIV22-AV0-61388963 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno GA ČR v roce 2022 | RIV/61388963:_____/21:00542459 v dodávce dat RIV22-GA0-61388963 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/61388963:_____/21:00542459 v dodávce dat RIV22-MSM-61388963 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |
|---|