Zpět na hledáníTranscriptome Remodeling of Differentiated Cells during Chronological Ageing of Yeast Colonies: New Insights into Metabolic Differentiation (2018)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216208:11310/18:10367146 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Transcriptome Remodeling of Differentiated Cells during Chronological Ageing of Yeast Colonies: New Insights into Metabolic Differentiation |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10600 - 1.6 Biological sciences |
| Rok uplatnění | 2018 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Eva Ježková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8273375) Jana Maršíková (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A) Zdena Palková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1892746) Derek Wilkinson (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska, domácí tvůrce: A) Ragnhild Aaløkken (státní příslušnost: NO - Norské království) Gregor Duncan Gilfillan (státní příslušnost: NO - Norské království) Otakar Hlaváček (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Libuše Váchová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We present the spatiotemporal metabolic differentiation of yeast cell subpopulations from upper, lower, and margin regions of colonies of different ages, based on comprehensive transcriptomic analysis. Furthermore, the analysis was extended to include smaller cell subpopulations identified previously by microscopy within fully differentiated U and L cells of aged colonies. New data from RNA-seq provides both spatial and temporal information on cell metabolic reprogramming during colony ageing and shows that cells at marginal positions are similar to upper cells, but both these cell types are metabolically distinct from cells localized to lower colony regions. As colonies age, dramatic metabolic reprogramming occurs in cells of upper regions, while changes in margin and lower cells are less prominent. Interestingly, whereas clear expression differences were identified between two L cell subpopulations, U cells (which adopt metabolic profiles, similar to those of tumor cells) form a more homogeneous cell population. The data identified crucial metabolic reprogramming events that arise de novo during colony ageing and are linked to U and L cell colony differentiation and support a role for mitochondria in this differentiation process. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | GENES;PROGRAM;MITOCHONDRIA;AMMONIA;EXPRESSION;NONCODING RNA;RETROGRADE RESPONSE;BIDIRECTIONAL PROMOTERS |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.hindawi.com/journals/omcl/2018/4932905/ |
| DOI výsledku | 10.1155/2018/4932905 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Oxidative Medicine and Cellular Longevity |
|---|---|
| ISSN | 1942-0900 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 2018 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | January |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 17 |
| Strana od-do | 1-17 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000423106400001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85042647306 |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2018 |
| Specifikace | RIV/00216208:11310/18:10367146!RIV18-MSM-11310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 07.05.2019 |
| Kontrolní číslo | 192075333 ( v2.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2019 | RIV/00216208:11310/18:10367146 v dodávce dat RIV19-GA0-11310___/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2019 | RIV/61388971:_____/18:00489466 v dodávce dat RIV19-AV0-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2019 | RIV/61388971:_____/18:00489466 v dodávce dat RIV19-GA0-61388971/01:3 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2019 | RIV/61388971:_____/18:00489466 v dodávce dat RIV19-MSM-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu 7F | 7F14083 - 3D yeast colony genomics: A model for cancer progression and development of drug resistance in biofilms (2014 - 2017) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu ED | ED1.1.00/02.0109 - Biotechnologické a biomedicínské centrum Akademie věd a Univerzity Karlovy (2012 - 2015) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LQ | LQ1604 - BIOCEV - od základního k aplikovanému výzkumu (2016 - 2020) |
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |