Zpět na hledáníEffects of post-mortem and physical degradation on RNA integrity and quality (2015)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216208:11310/15:10362452 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Effects of post-mortem and physical degradation on RNA integrity and quality |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/B - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi SCOPUS společnosti Elsevier s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jsc) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10600 - 1.6 Biological sciences |
| Rok uplatnění | 2015 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Monika Šídová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6082920) Pavel Abaffy (státní příslušnost: SK - Slovenská republika) Mikael Kubista (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Radek Šindelka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Silvie Tománková (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The precision and reliability of quantitative nucleic acid analysis depends on the quality of the sample analyzed and the integrity of the nucleic acids. The integrity of RNA is currently primarily assessed by the analysis of ribosomal RNA, which is the by far dominant species. The extrapolation of these results to mRNAs and microRNAs, which are structurally quite different, is questionable. Here we show that ribosomal and some nucleolar and mitochondrial RNAs, are highly resistant to naturally occurring post-mortem degradation, while mRNAs, although showing substantial internal variability, are generally much more prone to nucleolytic degradation. In contrast, all types of RNA show the same sensitivity to heat. Using qPCR assays targeting different regions of mRNA molecules, we find no support for 5' or 3' preferentiality upon post-mortem degradation. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | RT-qPCR;RQI;RNA quality;RNA integrity;Degradation |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2214753515300048 |
| DOI výsledku | 10.1016/j.bdq.2015.08.002 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Biomolecular Detection and Quantification [online] |
|---|---|
| ISSN | 2214-7535 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 2015 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 5 |
| Stát vydavatele periodika | DE - Spolková republika Německo |
| Počet stran výsledku | 7 |
| Strana od-do | 3-9 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-84943627995 |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2018 |
| Specifikace | RIV/00216208:11310/15:10362452!RIV18-MSM-11310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 23.05.2018 |
| Kontrolní číslo | 192028559 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2020 | RIV/86652036:_____/15:00523050 v dodávce dat RIV20-AV0-86652036/01:1 předkladatelem Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2020 | RIV/86652036:_____/15:00523050 v dodávce dat RIV20-MSM-86652036/01:1 předkladatelem Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu ED | ED1.1.00/02.0109 - Biotechnologické a biomedicínské centrum Akademie věd a Univerzity Karlovy (2012 - 2015) |
|---|---|
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |