Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216208:11110/19:10410368 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Proteomic Interactome of C. elegans Mediator Complex Subunit 28 (MDT-28) Reveals Predominant Association with a Restricted Set of Core Mediator Subunits and an Affinity to Additional Structural and Enzymatic Proteins |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10600 - 1.6 Biological sciences |
| Rok uplatnění | 2019 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 6 |
| Počet tvůrců celkem | 7 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Markéta Kostrouchová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6569196, orcid: 0000-0001-8705-1609, scopusid: 55989148600, researcherid: J-4735-2017) Marta Kostrouchová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3689042, orcid: 0000-0002-8147-7745, scopusid: 6602576167, researcherid: J-4673-2017) Veronika Kostrouchová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8215030, orcid: 0000-0001-8417-6721, scopusid: 55358545600, researcherid: K-1994-2017) Petr Yilma (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9943501, orcid: 0000-0001-9008-337X, scopusid: 24466053200, researcherid: N-1806-2017) David Kostrouch (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Novák (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Pavel Talacko (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0002-0943-4564, scopusid: 54392171200, researcherid: H-8921-2017) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Transcription factors exert their regulatory potential on RNA polymerase II machinery through a multiprotein complex called Mediator complex or Mediator. The Mediator complex integrates regulatory signals from cell regulatory cascades with the regulation by transcription factors. The Mediator complex consists of 25 subunits in Saccharomyces cerevisiae and 30 or more subunits in multicellular eukaryotes. Mediator subunit 28 (MED28), along with MED30, MED23, MED25 and MED26, belong to presumably evolutionarily new subunits that seem to be absent in unicellular eukaryotes and are likely to have evolved together with multicellularity and cell differentiation. Previously, we have shown that an originally uncharacterized predicted gene, F28F8.5, is the true MED28 orthologue in Caenorhabditis elegans (mdt-28) and showed that it is involved in a spectrum of developmental processes. Here, we studied the proteomic interactome of MDT-28 edited as GFP::MDT-28 using Crispr/Cas9 technology or MDT-28::GFP expressed from extrachromosomal arrays in transgenic C. elegans exploiting the GFPTRAP system and mass spectrometry. The results show that MDT-28 associates with the Head module subunits MDT-6, MDT-8, MDT-11, MDT-17, MDT20, MDT-22, and MDT-30 and the Middle module subunit MDT-14. The analyses also identified additional proteins as preferential MDT-28 interactants, including chromatin-organizing proteins, structural proteins and enzymes. The results provide evidence for MDT-28 engagement in the Mediator Head module and support the possibility of physical (direct or indirect) interaction of MDT-28 with additional proteins, reflecting the transcription-regulating potential of primarily structural and enzymatic proteins at the level of the Mediator complex. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | proteomic;MDT-28;MED28;Mediator complex;mass spectrometry;Head module;interactome;GPF-TRAP;Caenorhabditis elegans |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=SE~7TyoCSW |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Folia Biologica |
|---|---|
| ISSN | 0015-5500 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 65 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 5-6 |
| Stát vydavatele periodika | CZ - Česká republika |
| Počet stran výsledku | 9 |
| Strana od-do | 203-211 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000576686100001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85086354602 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2021 |
| Specifikace | RIV/00216208:11110/19:10410368!RIV21-MSM-11110___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 10.05.2021 |
| Kontrolní číslo | 192276395 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2021 | RIV/61388971:_____/19:00537783 v dodávce dat RIV21-AV0-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2021 | RIV/61388971:_____/19:00537783 v dodávce dat RIV21-MSM-61388971/01:2 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MZ v roce 2021 | RIV/61388971:_____/19:00537783 v dodávce dat RIV21-MZ0-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu ED | ED1.1.00/02.0109 - Biotechnologické a biomedicínské centrum Akademie věd a Univerzity Karlovy (2012 - 2015) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LQ | LQ1604 - BIOCEV - od základního k aplikovanému výzkumu (2016 - 2020) |
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |