| Identifikační kód |
RIV/00209805:_____/14:#0000538 |
| Název v původním jazyce | p-SRM, SWATH a HRM - cílené proteomické přístupy na hmotnostním spektrometru TripleTOF 5600+ a jejich aplikace v onkologickém výzkumu |
|---|
| Název v anglickém jazyce |
p-SRM, SWATH and HRM - Targeted proteomics approaches on TripleTOF 5600+ mass spectrometer and their applications in oncology research |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
cze - čeština |
| Obor - skupina |
F - Lékařské vědy |
| Obor |
FD - Onkologie a hematologie |
| Rok uplatnění |
2014 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
3 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Pavel Bouchal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2503786)
Jakub Faktor (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A)
Eva Michalová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7227078) |
| Popis výsledku v původním jazyce | Vývoj diagnostických a terapeutických přístupů v onkologii vyžaduje, kromě jiného, citlivé kvantitativní přístupy pro stanovení proteinů souvisejících s nádorovými procesy v klinických vzorcích. V tomto článku jsou představeny nové kvantitativní metody cílené proteomiky. Hlavní potenciál metod monitorování vybraných reakcí (SRM) a pseudo-SRM spočívá v kvantifikaci předem vybraných proteinů ve větších souborech vzorků s vysokou citlivostí a selektivitou, čímž představují alternativu ke stávajícím imunochemickým přístupům. Potenciál HRM a SWATH spočívá naopak v získávání digitálních proteomických fingerprintů, z nichž je následně možné extrahovat kvantitativní proteomická data na podobném principu jako u SRM. Článek představuje aplikace uvedených metod vřadě studií z oblasti onkologického výzkumu, kde byly použity ke stanovení a validaci stávajících i nově navrhovaných proteinových biomarkerů a při studiu jejich úlohy v mechanizmu vzniku a vývoje nádorů. |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Development of novel diagnostic and therapeutic approaches in cancer research requires sensitive and quantitative assays for determination of cancer-associated proteins in clinical samples. Novel quantitative targeted proteomic approaches are overviewedin this communication. A major advantage of selected reaction monitoring (SRM) and pseudo-SRM lies in the selective and sensitive quantification of selected proteins in large sample sets. As such, they represent an alternative to immunochemical approaches. On the other hand, the potential of HRM and SWATH lies in recording of digital fingerprints, which enable post-acquisition quantitative proteomic datamining on a similar basis to SRM. This article shows applications of targeted proteomics in a numberof cancer research studies where they were used for quantification and validation of current or potential protein biomarkers and to study their role in cancer development and progression. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
proteomics; selected reaction monitoring; oncology; SWATH; bio markers; molecular diagnostics |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/186/4499.pdf |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |