| Identifikační kód |
RIV/00209805:_____/13:#0000477 |
| Název v anglickém jazyce |
Integrative genome-wide gene expression profiling of clear cell renal cell carcinoma in Czech Republic and in the United States |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
F - Lékařské vědy |
| Obor |
FD - Onkologie a hematologie |
| Rok uplatnění |
2013 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
6 |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Gene expression microarray and next generation sequencing efforts on conventional, clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) have been mostly performed in North American and Western European populations, while the highest incidence rates are found in Central/Eastern Europe. We conducted whole-genome expression profiling on 101 pairs of ccRCC tumours and adjacent non-tumour renal tissue from Czech patients recruited within the "K2 Study'', using the Illumina HumanHT-12 v4 Expression BeadChips to explore the molecular variations underlying the biological and clinical heterogeneity of this cancer. Differential expression analysis identified 1650 significant probes (fold change >= 2 and false discovery rate <0.05) mapping to 630 up- and 720 down-regulated unique genes. We performed similar statistical analysis on the RNA sequencing data of 65 ccRCC cases from the Cancer Genome Atlas (TCGA) project and identified 60% (402) of the downregulated and 74% (469) of the upregulated genes found in t |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
kidney cancer; differential expression; Beta-Catein; RNA-seq; identification; survival; tumor; microarray; signatures; VHL |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0057886 |
| DOI výsledku |
10.1371/journal.pone.0057886 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |