| Identifikační kód |
RIV/00209805:_____/11:#0000153 |
| Název v původním jazyce | Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí |
|---|
| Název v anglickém jazyce |
Quantitation of protein biomarkers by mass spectrometry in selected reaction monitoring mode |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
cze - čeština |
| Obor - skupina |
E - Biovědy |
| Obor |
EB - Genetika a molekulární biologie |
| Rok uplatnění |
2011 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
2 |
| Počet tvůrců celkem |
6 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Pavel Bouchal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2503786)
Iva Struhárová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2474115)
Bořivoj Vojtěšek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9637419) |
| Popis výsledku v původním jazyce | Monitorování vybraných reakcí (SRM) patří do kvantitativních metod hmotnostní spektrometrie, které lze také uplatnit v analýze peptidů. Hmotnostní spektrometry určené pro SRM analýzu jsou spojeny s nanoHPLC, mají iontový zdroj nanoelektrosprej a trojitýkvadrupólový analyzátor. V prinicpu, první kvadrupol funguje jako hmotnostní filtr, který propustí pouze vybraný peptidový iont, který je fragmentován v druhém kvadrupólu quadupole přes kolizní celu. Třetí kvadrupól přenáší vybrané peptidocé fragmenty směrem k detektoru. Tento přístup umožňuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v rámci jediné analýzy a to s velmi dobrou citlivostí a selektivností. SRM se tak stává klíčovou metodou proteomiky. Hlavním odvětvím jejího použití spočívá v rychlém stanovení proteinů v rámci rozsáhlých souborů vzorků. |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Selected reaction monitoring (SRM) is a quantitative MS-based method which recently expanded to analysis of proteins by determination of peptides. The instrumentation consists of a nanoflow liquid chromatograph coupled with nanoelectrospray ionization and a triple-quadrupole mass spectrometer. In principle, the first quadrupole works as a mass filter, transmitting only a selected peptide, which is fragmented in a second quadupole via collision-induced dissociation. The third quadrupole transmits the selected peptide fragments, which are then directed to the detector. This approach enables targeted quantification of tens of proteins in a single analysis with very good sensitivity and selectivity. The SRM becomes a key method in a new targeted-proteomicstoolbox. The most important field of its applications lies in the life sciences research where SRM enables fast, accurate and cost-effective determination of proteins in large sets of samples. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
protein quantitation; mass spektrometry; proteomics |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2011_11_846-850.pdf |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |