Zpět na hledáníMolecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines (2014)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00027006:_____/14:00002970 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Molecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | E - Biovědy |
| Obor | EE - Mikrobiologie, virologie |
| Rok uplatnění | 2014 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Petr Komínek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5557534) T. Candresse (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) M. Glasa (státní příslušnost: SK - Slovenská republika) A. Nagyová (státní příslušnost: SK - Slovenská republika) A. Olmos (státní příslušnost: ES - Španělské království) L. Predajňa (státní příslušnost: SK - Slovenská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Analysis of complete genome sequences of three Slovak isolates of grapevine Pinot gris virus (GPGV) showed their low heterogeneity (reaching 1.7 %) and a close relationship to the Italian NC_015782 isolate (4.2-4.5 % divergence). Comparison of Slovak andItalian isolates revealed an unusual accumulation of 21 indel mutations in ORF1, resulting in a localized high divergence in the encoded amino acid sequences. An elevated divergence in the 5' extremity of the GPGV genomes is suggestive of a recombination between Slovak isolates and grapevine berry inner necrosis virus. RT-PCR allowed the frequent detection of closely related GPGV isolates in grapevines from Slovakia and the Czech Republic. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Trichovirus; Next-generation sequencing; Diversity; Detection |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1007/s00705-014-2031-5 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Archives of Virology |
|---|---|
| ISSN | 0304-8608 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 159 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 8 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 5 |
| Strana od-do | 2103-2107 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000339888300024 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. |
|---|---|
| Dodavatel | MZE - Ministerstvo zemědělství (MZe) |
| Rok sběru | 2015 |
| Specifikace | RIV/00027006:_____/14:00002970!RIV15-MZE-00027006 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 20.05.2015 |
| Kontrolní číslo | 152363009 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný MZe | MZE0002700604 - Udržitelné systémy pěstování zemědělských plodin pro produkci kvalitních a bezpečných potravin, krmiv a surovin (2009 - 2013) |
|---|