Zpět na hledáníThe choice of reference gene set for assessing gene expression in barley (Hordeum vulgare L.) under low temperature and drought stress (2013)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00027006:_____/13:00002634 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | The choice of reference gene set for assessing gene expression in barley (Hordeum vulgare L.) under low temperature and drought stress |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | G - Zemědělství |
| Obor | GE - Šlechtění rostlin |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 7 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jan Hodek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9998950) Anna Janská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4949811) Jaroslava Ovesná (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9505024) Ilja Prášil (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5347084) Pavel Svoboda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2855445) Eva Vlasáková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1003569) Jiří Zámečník (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5390079) L. Milella (státní příslušnost: IT - Italská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We describe here a comparison of various candidate reference genes in the context of the response of barley to drought or low-temperature stress, and for the first time targeting the different response of barley leaf and crown to low temperature and drought stresses. It was possible to show that the use of a single reference gene was insufficient for normalization purposes. The results confirmed that reference gene expression is a primary need in qRT-PCR in barley and demonstrated that the correct choice of appropriate genes is essential and strictly related to stress and plant tissues. These results provide for the first time clear guidelines for the selection of reference genes in barley leaf and crowns under temperature and drought-stress conditions. This information would contribute toward more accurate and widespread use of qRT-PCR in barley gene analysis which is crucial to understand response mechanisms. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | crowns; drought; leaves; low; temperature; normalization; real-time RT PCR |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1007/s00438-013-0774-4 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Molecular Genetics and Genomics |
|---|---|
| ISSN | 1617-4615 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 288 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 11 |
| Stát vydavatele periodika | DE - Spolková republika Německo |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | 639-649 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000326263900008 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. |
|---|---|
| Dodavatel | MZE - Ministerstvo zemědělství (MZe) |
| Rok sběru | 2014 |
| Specifikace | RIV/00027006:_____/13:00002634!RIV14-MZE-00027006 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 30.05.2014 |
| Kontrolní číslo | 56561349 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | RIV/00027006:_____/13:00002634 v dodávce dat RIV14-MSM-00027006/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | RIV/00216208:11310/13:10195352 v dodávce dat RIV14-MSM-11310___/01:1 předkladatelem Univerzita Karlova v Praze / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodáno MZe v roce 2014 | RIV/00216208:11310/13:10195352 v dodávce dat RIV14-MZE-11310___/01:1 předkladatelem Univerzita Karlova v Praze / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu OC | OC09032 - Výběr klíčových genů stresové odpovědi rostlin: využití transkriptomiky a bioinformatiky (2009 - 2011) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MZe v programu QH | QH81287 - Studium strategie adaptace ječmene a planého druhu na stresy pomocí transkriptomiky a proteomiky jako základ pro rozvoj biotechnologií (2008 - 2012) |
| Výzkumný záměr podporovaný MZe | MZE0002700604 - Udržitelné systémy pěstování zemědělských plodin pro produkci kvalitních a bezpečných potravin, krmiv a surovin (2009 - 2013) |