Zpět na hledáníREddyProc – Post-Processing of (Half-)Hourly Eddy Covariance Measurements (2018)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/86652079:_____/18:00499627 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | REddyProc – Post-Processing of (Half-)Hourly Eddy Covariance Measurements |
| Druh | R - Software |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10509 - Meteorology and atmospheric sciences |
| Rok uplatnění | 2018 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 7 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Ladislav Šigut (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6304370, researcherid: B-4382-2013) A. Lucas-Moffat (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) O. Menzer (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) M. Migliavacca (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) M. Reichstein (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) K. Sickel (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) P. Wutzler (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | With the eddy covariance (EC) technique, net fluxes of carbon dioxide (CO2) and other trace gases as well as water and energy fluxes can be measured at the ecosystem level. These flux measurements are a main source for understanding biosphere–atmosphere interactions and feedbacks through cross-site analysis, model–data integration, and upscaling. The raw fluxes measured with the EC technique require extensive and laborious data processing. While there are standard tools1 available in an open-source environment for processing high-frequency (10 or 20Hz) data into half-hourly quality-checked fluxes, there is a need for more usable and extensible tools for the subsequent post-processing steps. We tackled this need by developing the REddyProc package in the cross-platform language R that provides standard CO2-focused post-processing routines for reading (half-)hourly data from different formats, estimating the u* threshold, as well as gap-filling, flux-partitioning, and visualizing the results. In addition to basic processing, the functions are extensible and allow easier integration in extended analysis than current tools. New features include cross-year processing and a better treatment of uncertainties. A comparison of REddyProc routines with other state-of-the-art tools resulted in no significant differences in monthly and annual fluxes across sites. Lower uncertainty estimates of both u* and resulting gap-filled fluxes by 50% with the presented tool were achieved by an improved treatment of seasons during the bootstrap analysis. Higher estimates of uncertainty in daytime partitioning (about twice as high) resulted from a better accounting for the uncertainty in estimates of temperature sensitivity of respiration. The provided routines can be easily installed, configured, and used. Hence, the eddy covariance community will benefit from the REddyProc package, allowing easier integration of standard post-processing with extended analysis. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | eddy covariance;post-processing;ustar filtering;gap-filling;flux partitioning;reproducible science |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://github.com/bgctw/REddyProc |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Interní identifikační kód produktu přidělený tvůrcem | REddyProc 1.1.6 |
|---|---|
| Technické parametry | Eddy kovariance (EC) je mikrometeorologická technika, která umožňuje kontinuální kvantifikaci výměnu látek a energie mezi ekosystémem a atmosférou. Taková měření jsou důležitá pro pochopení ekofyziologických procesů a jejich dynamiky a tím i zobecnění výsledků v širším prostorovém měřítku. Tento balíček načítá data produkovaná softwarem, který převádí vysokofrekvenční měření na (půl)hodinové produkty a umožňuje jejich další zpracování. Zde implementované standardní a rozšiřitelné schéma zpracování eddy kovariančních dat (blíže popsáno ve Wutzler et al., 2018, doi:10.5194/bg-15-5015-2018) zahrnuje ustar filtrování, doplňování dat a separaci toků. Software podléhá licenci GPL >= 2 (Všeobecná veřejná licence GNU, verze 2 a vyšší). |
| Ekonomické parametry | Zpracování eddy kovariančních dat je časově náročné a vyžaduje expertní mezioborové znalosti. Formalizace výpočetních úkonů v podobě softwaru výrazně šetří čas potřebný ke zpracování dat a přináší tak úsporu v oblasti lidských zdrojů. |
| IČ vlastníka výsledku | 86652079 |
| Název vlastníka | Ústav výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i. |
| Druh možnosti využití výsledku | N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován) |
| Požadavek na licenční poplatek | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav výzkumu globální změny v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2019 |
| Specifikace | RIV/86652079:_____/18:00499627!RIV19-AV0-86652079 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 14.05.2019 |
| Kontrolní číslo | 192100875 ( v1.0 ) |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |
|---|