| Identifikační kód |
RIV/68378050:_____/12:00381590 |
| Název v anglickém jazyce |
Transcriptional provirus silencing as a crosstalk of de novo DNA methylation and epigenomic features at the integration site |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
E - Biovědy |
| Obor |
EB - Genetika a molekulární biologie |
| Rok uplatnění |
2012 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
2 |
| Počet tvůrců celkem |
3 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Miroslav Auxt (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9936246)
Jiří Hejnar (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5103215)
Filip Šenigl (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3845478) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
The autonomous transcription of integrated retroviruses strongly depends on genetic and epigenetic effects of the chromatin at the site of integration. These effects are mostly suppressive and proviral activity can be finally silenced by mechanisms, suchas DNA methylation and histone modifications. To address the role of the integration site at the whole-genome-scale, we performed clonal analysis of provirus silencing with an avian leucosis/sarcoma virus-based reporter vector and correlated the transcriptional silencing with the epigenomic landscape of respective integrations. We demonstrate efficient provirus silencing in human HCT116 cell line, which is strongly but not absolutely dependent on the de novo DNA methyltransferase activity, particularlyof Dnmt3b. Proviruses integrated close to the transcription start sites of active genes into the regions enriched in H3K4 trimethylation display long-term stability of expression and are resistant to the transcriptional silencing after o |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
retrovirus integration; provirus silencing; epigenomics |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| DOI výsledku |
10.1093/nar/gks197 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |