Zpět na hledáníSimulations of A-RNA duplexes. The effect of sequence, solute force field, water model, and salt concentration (2012)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/12:00384749 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Simulations of A-RNA duplexes. The effect of sequence, solute force field, water model, and salt concentration |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2012 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 6 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Pavel Banáš (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1878220) Ivana Beššeová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6620450) Michal Otyepka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3151948) Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779) P. Košinová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Kührová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The set of explicit solvent MD simulations of A-RNA duplexes show that the A-RNA compactness is modestly affected by used water model, while the effect of ionic conditions. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | A-RNA; molecular dynamics; force field |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1021/jp3014817 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Physical Chemistry B |
|---|---|
| ISSN | 1520-6106 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 116 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 33 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 18 |
| Strana od-do | 9899-9916 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000307749100003 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2013 |
| Specifikace | RIV/68081707:_____/12:00384749!RIV13-AV0-68081707 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 05.09.2013 |
| Kontrolní číslo | 43534864 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | RIV/68081707:_____/12:00384749 v dodávce dat RIV13-GA0-68081707/02:2 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | RIV/00216224:14740/12:00057883 v dodávce dat RIV13-GA0-14740___/02:2 předkladatelem Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | RIV/61989592:15310/12:33142844 v dodávce dat RIV13-GA0-15310___/02:3 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2013 | RIV/00216224:14740/12:00057883 v dodávce dat RIV13-MSM-14740___/01:1 předkladatelem Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
| Dodáno MŠMT v roce 2013 | RIV/61989592:15310/12:33142844 v dodávce dat RIV13-MSM-15310___/02:2 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040702 - Genom a epigenom: 1D a 3D struktura, dynamika, interakce s proteiny a funkce (2007 - 2013) |
|---|