Zpět na hledáníNext-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B (2014)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/61389030:_____/14:00432722 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | E - Biovědy |
| Obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Rok uplatnění | 2014 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Počet tvůrců celkem | 16 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jaroslav Doležel (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1800477) Hana Šimková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5207010) H. Handa (státní příslušnost: JP - Japonsko) G. P. Joshi (státní příslušnost: JP - Japonsko) F. Kobayashi (státní příslušnost: JP - Japonsko) S. Nasuda (státní příslušnost: JP - Japonsko) T. Tanaka (státní příslušnost: JP - Japonsko) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important cereals in the world. To improve wheat quality and productivity, the genomic sequence of wheat must be determined. The large genome size (similar to 17 Gb/1 C) and the hexaploid status of wheat have hampered the genome sequencing of wheat. However, flow sorting of individual chromosomes has allowed us to purify and separately shotgun-sequence a pair of telocentric chromosomes. Here, we describe a result from the survey sequencing of wheatchromosome 6B (914 Mb/1 C) using massively parallel 454 pyrosequencing. From the 4.94 and 5.51 Gb shotgun sequence data from the two chromosome arms of 6BS and 6BL, 235 and 273 Mb sequences were assembled to cover similar to 55.6 and 54.9% of the total genomic regions, respectively. Repetitive sequences composed 77 and 86% of the assembled sequences on 6BS and 6BL, respectively. Within the assembled sequences, we predicted a total of 4798 non-repetitive gene loci with the evidence of exp |
| Klíčová slova oddělená středníkem | wheat; chromosome 6B; genome sequencing |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1093/dnares/dst041 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Dna Research |
|---|---|
| ISSN | 1340-2838 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 21 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 2 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 12 |
| Strana od-do | 103-114 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000339897500001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2015 |
| Specifikace | RIV/61389030:_____/14:00432722!RIV15-AV0-61389030 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 18.05.2015 |
| Kontrolní číslo | 152404440 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2015 | RIV/61389030:_____/14:00432722 v dodávce dat RIV15-GA0-61389030/01:1 |
|---|
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |
|---|