Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/61388963:_____/21:00545666 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Inverse Conformational Selection in Lipid-Protein Binding |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10403 - Physical chemistry |
| Rok uplatnění | 2021 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 19 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Matti Javanainen (státní příslušnost: FI - Finská republika, domácí tvůrce: A, orcid: 0000-0003-4858-364X, researcherid: I-6074-2015) A. Bacle (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) P. Buslaev (státní příslušnost: RU - Ruská federace) F. Favela-Rosales (státní příslušnost: MX - Spojené státy mexické) P. F. J. Fuchs (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) R. Garcia-Fandino (státní příslušnost: ES - Španělské království) I. Gushchin (státní příslušnost: RU - Ruská federace) A. M. Kiirikki (státní příslušnost: FI - Finská republika) J. J. Madsen (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) J. Melcr (státní příslušnost: NL - Nizozemsko) T. Mendes Ferreira (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) M. S. Miettinen (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) P. Milán Rodríguez (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) O. H. S. Ollila (státní příslušnost: FI - Finská republika) C. G. Papadopoulos (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) A. Peón (státní příslušnost: PT - Portugalská republika) T. J. Piggot (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) Á. Piñeiro (státní příslušnost: ES - Španělské království) S. Virtanen (státní příslušnost: FI - Finská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Interest in lipid interactions with proteins and other biomolecules is emerging not only in fundamental biochemistry but also in the field of nanobiotechnology where lipids are commonly used, for example, in carriers of mRNA vaccines. The outward-facing components of cellular membranes and lipid nanoparticles, the lipid headgroups, regulate membrane interactions with approaching substances, such as proteins, drugs, RNA, or viruses. Because lipid headgroup conformational ensembles have not been experimentally determined in physiologically relevant conditions, an essential question about their interactions with other biomolecules remains unanswered: Do headgroups exchange between a few rigid structures, or fluctuate freely across a practically continuous spectrum of conformations? Here, we combine solid-state NMR experiments and molecular dynamics simulations from the NMRlipids Project to resolve the conformational ensembles of headgroups of four key lipid types in various biologically relevant conditions. We find that lipid headgroups sample a wide range of overlapping conformations in both neutral and charged cellular membranes, and that differences in the headgroup chemistry manifest only in probability distributions of conformations. Furthermore, the analysis of 894 protein-bound lipid structures from the Protein Data Bank suggests that lipids can bind to proteins in a wide range of conformations, which are not limited by the headgroup chemistry. We propose that lipids can select a suitable headgroup conformation from the wide range available to them to fit the various binding sites in proteins. The proposed inverse conformational selection model will extend also to lipid binding to targets other than proteins, such as drugs, RNA, and viruses. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | membrane lipids;phosphatidylcholine headgroup;phospholipid binding |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://doi.org/10.1021/jacs.1c05549 |
| DOI výsledku | 10.1021/jacs.1c05549 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | https://zenodo.org/record/5118637#.YbCLL7qLpaQ |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of the American Chemical Society |
|---|---|
| ISSN | 0002-7863 |
| e-ISSN | 1520-5126 |
| Svazek periodika | 143 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 34 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 9 |
| Strana od-do | 13701-13709 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000704514200028 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85114164673 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2022 |
| Specifikace | RIV/61388963:_____/21:00545666!RIV22-AV0-61388963 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 02.05.2022 |
| Kontrolní číslo | 192344169 ( v1.0 ) |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |
|---|