Identifikační kód |
RIV/61388963:_____/08:00310559 |
Název v anglickém jazyce |
Correlation between the thermodynamic stability of DNA duplexes and the interaction and solvation energies of DNA building blocks |
Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
Poddruh |
- |
Jazyk |
eng - angličtina |
Obor - skupina |
C - Chemie |
Obor |
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie |
Rok uplatnění |
2008 |
Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku |
3 |
Počet tvůrců celkem |
2 |
Počet domácích tvůrců |
2 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Pavel Hobza (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2932016) Jan Řezáč (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5993768) |
Popis výsledku v anglickém jazyce |
The unwinding Gibbs energy (or duplex dissociation energy) is an important measure of the thermodynamic stability of DNA oligomers. This value can be measured experimentally or predicted by empirical models parametrised on experimental data. Our previously developed model based on accurate DFT-D calculations of interaction energies between nucleic acid bases corrected for solvation contribution. This work was successfully extended to cover variable lengths of oligomers. This model was further applied tooligomers containing inosine, an unnatural base. The results, however, are not satisfactory and it is clear that the model does not take into account all variables contributing to DNA stability. |
Klíčová slova oddělená středníkem |
DNA duplex; interaction energy; stability |
Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
Odkaz na údaje z výzkumu |
- |