Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníLM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020-2022, MSM/LM)

Identifikační kód	LM2018131
Důvěrnost údajů	S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce	Česká národní infrastruktura pro biologická data
Název projektu anglicky	Czech National Infrastructure for Biological Data
Poskytovatel	MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT)
Program	LM - Projekty velkých výzkumných infrastruktur  (2010 - 2026)
Kategorie VaV	IF - Infrastruktura výzkumu, vývoje a inovací
Hlavní vědní obor	10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Vedlejší vědní obor	-
Další vedlejší vědní obor	-
Zahájení řešení	01.01.2020
Ukončení řešení	31.12.2022
Datum posledního uvolnění účelové podpory	20.04.2022
Číslo smlouvy	MSMT-33353/2019-30
Poslední stav řešení	U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
Kčtis. Kč ** Finance projektu 2020 2021 2022 celkem Výše podpory z národních zdrojů 49 641 000,0049641 48 742 000,0048742 48 462 000,0048462 146 845 000,00146845 Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** 0,000 0,000 0,000 0,000 Celkové uznané náklady 49 641 000,0049641 48 742 000,0048742 48 462 000,0048462 146 845 000,00146845 Typ čerpané čerpané čerpané ** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa *** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů » Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů 2020 2021 2022 celkem Finance 49 641 000,0049641 48 742 000,0048742 48 462 000,0048462 146 845 000,00146845
Druh soutěže	VL - Projekt schválený vládou ČR
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích	-
Cíle řešení v původním jazyce	ELIXIR CZ, česká národní infrastruktura pro biologická data je zaměřena na zpracování, uchovávání, sdílení a analýzu dat v oblasti věd o živé přírodě. Cílem projektu je zajistit, aby data generovaná ostatními infrastrukturami splňovala kritéria FAIR – findable, accessible, interoperable and reusable, nutná k jejich plnému využití. Infrastruktura ELIXIR CZ je založena na expertní části zajišťované unikátním know-how špičkových odborníků z oblasti bioinformatiky, genomiky, biologie, medicíny, informatiky a počítačového inženýrství a na technické části spočívající v heterogenním souboru hardware a software prostředků a specifických architektur podle povahy zpracovávaných dat. Toto unikátní technické řešení je naplňováno především přímým zapojením e-infrastruktur zodpovědných za pokročilá IT řešení, budování datových úložišť, přístup k datům a výpočetním kapacitám. Cílem infrastruktury ELIXIR CZ je provozování pokročilých bioinformatických nástrojů, unikátních a zároveň interoperabilních datových zdrojů pro všechna odvětví současné biologie, školení odborníků a řešení pro dedikaci výpočetních prostředků a jejich specifických technických parametrů podle potřeb uživatelské komunity. Základním prvkem pro přístup a sdílení dat jsou nástroje pro autorizaci a autentizaci uživatelů, které umožňují přístup k datovým zdrojům a nástrojům. Jde většinou o vysoce rozvinuté metody, které jsou na základě schopnosti identifikovat uživatele používány pro přístup k datovým zdrojům včetně těch, které se týkají vysoce citlivých dat. Obecně představuje toto řešení technologii použitelnou ve všech disciplínách pracujících se sdílenými daty napříč vědami o živé přírodě a v podstatě i mimo ni. ELIXIR CZ se výrazně profiluje v oblasti správy dat (Data Management), a to od úrovně uživatelů po úroveň administrátorů vědeckých projektů. Koncepce a nástroje v této oblasti jsou aplikovatelné na řešení procesů od generování dat po jejich archivaci a využitelnost.
Cíle řešení v anglickém jazyce	Czech National Infrastructure for Biological Data ELIXIR CZ is focused on processing, storage, sharing and analysis of data in life sciences. The aim of the project is to ensure that the data generated by other infrastructures meets the FAIR principles - findable, accessible, interoperable and reusable. These principles are necessary for full utilization the acquire data. The ELIXIR CZ infrastructure is based on the unique know-how of top experts in the fields of bioinformatics, genomics, biology, medicine, informatics and computer engineering. Furthermore ELIXIR CZ provides hardware and software resources and specific architectures according to the nature of processed data. This unique technical solution is primarily fulfilled by e-infrastructures responsible for advanced IT solutions, building data storage, access to data and computing capacities. The aim of the ELIXIR CZ infrastructure is to operate advanced bioinformatics tools, unique and at the same time interoperable data sources for all branches of biology, training of specialists and solutions for dedication of computing resources and their specific technical parameters according to the needs of the user community. The highly developed authorization and authentication tools, which provide access to data sources, are based on their ability to identify users including those relating to highly sensitive data. In general, this solution is a technology applicable to all shared data disciplines across life sciences and essentially beyond. ELIXIR CZ has a strong profile in the area of Data Management, from the level of users to the level of administrators of scientific projects. The concepts and tools in this area are applicable to process solutions from data generation to archiving and usability.
Klíčová slova v anglickém jazyce	biological data;data transfer;databases;interoperability
Kontrolní číslo stavu projektu v letech	2020: 190761721 ( v3.0 ) 2021: 190761719 ( v3.0 ) 2022: 190761720 ( v2.0 ) 2023: 190761718 ( v2.0 )
Datum dodání posledního záznamu o projektu	18.10.2024
Systémové označení dodávky dat	CEP23-MSM-LM-U

Účastníci projektu

Počet příjemců	1
Počet dalších účastníků projektu	13

Příjemce	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
RIS ZED - ID Akce	Z331901000038 (externí ID: LM2018131_61388963, agregační ID: Z331901000000)
Řešitel	doc. RNDr. Jiří Vondrášek, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 7358946)

Další účastník projektu	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Řešitel	RNDr. Jiří Macas, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5717817)

Další účastník projektu	Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Řešitel	Ing. Jiří Černý, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5461162)

Další účastník projektu	CESNET, zájmové sdružení právnických osob
Řešitel	Ing. Helmut Sverenyák (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 2059118)

Další účastník projektu	Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně
Řešitel	Prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 1030175)

Další účastník projektu	Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Řešitel	Ing. Jiří Vohradský, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 7810342)

Další účastník projektu	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Řešitel	Mgr. Jan Pačes, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5655749)

Další účastník projektu	České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií
Řešitel	doc. Ing. Robert Pergl, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3940551)

Další účastník projektu	Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Řešitel	Ing. Rudolf Vohnout, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 9060316)

Další účastník projektu	Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Řešitel	doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3876500)

Další účastník projektu	Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Řešitel	RNDr. Marian Novotný, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5271525)

Další účastník projektu	Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Řešitel	RNDr. Karel Berka, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 4936094)

Další účastník projektu	Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Řešitel	doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 9836861)

Další účastník projektu	Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd
Řešitel	Ing. Lucie Houdová, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 8948682)

Kčtis. Kč **

Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady	2020	2021	2022
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	7 755 000,007755	7 804 000,007804	7 649 000,007649
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.	2 790 000,002790	2 565 000,002565	2 515 000,002515
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.	1 858 000,001858	1 910 000,001910	1 873 000,001873
CESNET, zájmové sdružení právnických osob	3 322 000,003322	3 866 000,003866	4 448 000,004448
České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií	3 241 000,003241	3 001 000,003001	2 942 000,002942
Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně	3 759 000,003759	4 095 000,004095	3 886 000,003886
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta	2 227 000,002227	2 048 000,002048	2 008 000,002008
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	9 953 000,009953	9 374 000,009374	9 213 000,009213
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.	3 488 000,003488	3 345 000,003345	3 413 000,003413
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta	2 662 000,002662	2 879 000,002879	2 821 000,002821
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta	3 340 000,003340	3 072 000,003072	3 011 000,003011
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.	1 806 000,001806	1 664 000,001664	1 627 000,001627
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie	1 670 000,001670	1 536 000,001536	1 505 000,001505
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd	1 770 000,001770	1 583 000,001583	1 551 000,001551

Výše podpory z národních zdrojů	2020	2021	2022
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	7 755 000,007755	7 804 000,007804	7 649 000,007649
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.	2 790 000,002790	2 565 000,002565	2 515 000,002515
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.	1 858 000,001858	1 910 000,001910	1 873 000,001873
CESNET, zájmové sdružení právnických osob	3 322 000,003322	3 866 000,003866	4 448 000,004448
České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií	3 241 000,003241	3 001 000,003001	2 942 000,002942
Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně	3 759 000,003759	4 095 000,004095	3 886 000,003886
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta	2 227 000,002227	2 048 000,002048	2 008 000,002008
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	9 953 000,009953	9 374 000,009374	9 213 000,009213
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.	3 488 000,003488	3 345 000,003345	3 413 000,003413
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta	2 662 000,002662	2 879 000,002879	2 821 000,002821
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta	3 340 000,003340	3 072 000,003072	3 011 000,003011
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.	1 806 000,001806	1 664 000,001664	1 627 000,001627
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie	1 670 000,001670	1 536 000,001536	1 505 000,001505
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd	1 770 000,001770	1 583 000,001583	1 551 000,001551

Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů	2020	2021	2022
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
CESNET, zájmové sdružení právnických osob	0,000	0,000	0,000
České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií	0,000	0,000	0,000
Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně	0,000	0,000	0,000
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	0,000	0,000	0,000
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie	0,000	0,000	0,000
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd	0,000	0,000	0,000

Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce	2020	2021	2022
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
CESNET, zájmové sdružení právnických osob	0,000	0,000	0,000
České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií	0,000	0,000	0,000
Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně	0,000	0,000	0,000
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	0,000	0,000	0,000
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie	0,000	0,000	0,000
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd	0,000	0,000	0,000

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka během jednotlivých let	2020	2021	2022
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	7 755 000,007755	7 804 000,007804	7 649 000,007649
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.	2 790 000,002790	2 565 000,002565	2 515 000,002515
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.	1 858 000,001858	1 910 000,001910	1 873 000,001873
CESNET, zájmové sdružení právnických osob	3 322 000,003322	3 866 000,003866	4 448 000,004448
České vysoké učení technické v Praze / Fakulta informačních technologií	3 241 000,003241	3 001 000,003001	2 942 000,002942
Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně	3 759 000,003759	4 095 000,004095	3 886 000,003886
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta	2 227 000,002227	2 048 000,002048	2 008 000,002008
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	9 953 000,009953	9 374 000,009374	9 213 000,009213
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.	3 488 000,003488	3 345 000,003345	3 413 000,003413
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta	2 662 000,002662	2 879 000,002879	2 821 000,002821
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta	3 340 000,003340	3 072 000,003072	3 011 000,003011
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.	1 806 000,001806	1 664 000,001664	1 627 000,001627
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie	1 670 000,001670	1 536 000,001536	1 505 000,001505
Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd	1 770 000,001770	1 583 000,001583	1 551 000,001551

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem	286
Výsledek druhu J	RIV/00064203:_____/21:10432537 - Disease progression of 213 patients hospitalized with Covid-19 in the Czech Republic in March-October 2020: An exploratory analysis (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/21:00075131 - Screening of Natural Compounds as P-Glycoprotein Inhibitors against Multidrug Resistance (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/21:00075155 - SoluProt: prediction of soluble protein expression in Escherichia coli (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/21:00075247 - Web-based tools for computational enzyme design (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/21:00075903 - Fully Automated Ancestral Sequence Reconstruction using FireProtASR (2021)
Výsledek druhu R	RIV/00159816:_____/21:00075921 - CaverWeb 1.1 (2021)
Výsledek druhu R	RIV/00159816:_____/21:00075922 - Database FireProt DB 1.1 (2021)
Výsledek druhu R	RIV/00159816:_____/21:00075924 - SoluProt 1.0 (2021)
Výsledek druhu R	RIV/00159816:_____/21:00075925 - SoluProtMut DB 1.0 (2021)
Výsledek druhu R	RIV/00159816:_____/21:00075929 - Protein Data Bank in Europe – Knowledge Base (PDBe-KB) (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077602 - Tools for computational design and high-throughput screening of therapeutic enzymes (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077609 - LoopGrafter: a web tool for transplanting dynamical loops for protein engineering (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077616 - Mechanism-Based Strategy for Optimizing HaloTag Protein Labeling (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077619 - CalFitter 2.0: Leveraging the power of singular value decomposition to analyse protein thermostability (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077637 - Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077679 - Fast approximative methods for study of ligand transport and rational design of improved enzymes for biotechnologies (2022)
Výsledek druhu R	RIV/00159816:_____/22:00077707 - Caver Web 1.2 (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077741 - PDBe-KB: collaboratively defining the biological context of structural data (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077750 - Computer-aided engineering of staphylokinase toward enhanced affinity and selectivity for plasmin (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077757 - Structural Insights into (Tere)phthalate-Ester Hydrolysis by a Carboxylesterase and Its Role in Promoting PET Depolymerization (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077764 - Advanced database mining of efficient haloalkane dehalogenases by sequence and structure bioinformatics and microfluidics (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00077766 - Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/22:00078809 - SoluProtMutDB: A manually curated database of protein solubility changes upon mutations (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/23:00079599 - In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/23:00079724 - Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer's Disease drug candidate (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00159816:_____/23:00079746 - Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11110/20:10418559 - Single-Cell RNA Sequencing Unravels Heterogeneity of the Stromal Niche in Cutaneous Melanoma Heterogeneous Spheroids (2020)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11110/21:10432537 - Disease progression of 213 patients hospitalized with Covid-19 in the Czech Republic in March-October 2020: An exploratory analysis (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11110/21:10438285 - Evidence for the Association between the Intronic Haplotypes of Ionotropic Glutamate Receptors and First-Episode Schizophrenia (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11110/22:10445458 - Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11110/23:10465311 - Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11130/21:10432537 - Disease progression of 213 patients hospitalized with Covid-19 in the Czech Republic in March-October 2020: An exploratory analysis (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11140/21:10432537 - Disease progression of 213 patients hospitalized with Covid-19 in the Czech Republic in March-October 2020: An exploratory analysis (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11140/23:10465311 - Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/21:10430985 - The Mastigamoeba balamuthi Genome and the Nature of the Free-Living Ancestor of Entamoeba (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/21:10434120 - Synthesis, Coordination and Electrochemistry of a Ferrocenyl-Tagged Aminobisphosphane Ligand (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/21:10435459 - High Cysteine Diet Reduces Insulin Resistance in SHR-CRP Rats (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/21:10436441 - Predominant Biphenyl Dioxygenase From Legacy Polychlorinated Biphenyl (PCB)-Contaminated Soil Is a Part of Unusual Gene Cluster and Transforms Flavone and Flavanone (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/21:10438285 - Evidence for the Association between the Intronic Haplotypes of Ionotropic Glutamate Receptors and First-Episode Schizophrenia (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10441395 - Mechanisms of the host immune response and helminth-induced pathology during Trichobilharzia regenti (Schistosomatidae) neuroinvasion in mice (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10448337 - PrankWeb 3: accelerated ligand-binding site predictions for experimental and modelled protein structures (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10450634 - Secondary Structures of Proteins Follow Menzerath–Altmann Law (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10450720 - DisProt in 2022: improved quality and accessibility of protein intrinsic disorder annotation (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10453742 - Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10454583 - Sex chromosome differentiation via changes in the Y chromosome repeat landscape in African annual killifishes Nothobranchius furzeri and N. kadleci (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10455491 - AHoJ: rapid, tailored search and retrieval of apo and holo protein structures for user-defined ligands (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10457215 - Supernova: A Deoxyribozyme that Catalyzes a Chemiluminescent Reaction (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/22:10458346 - Fusion of two unrelated protein domains in a chimera protein and its 3D prediction: Justification of the X-ray reference structures as a prediction benchmark (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/23:10452309 - Synthesis and coordination of a pair of isomeric ferrocene phosphinoamines (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/23:10465271 - Divergent evolution drives high diversity of toll-like receptors (TLRs) in passerine birds: Buntings and finches (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/23:10465311 - Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11310/23:10477140 - Fast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes (2023)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/20:10414260 - Detailed Analysis and Optimization of CUDA K-means Algorithm (2020)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/20:10417772 - SOMHunter: Lightweight Video Search System with SOM-Guided Relevance Feedback (2020)
Výsledek druhu R	RIV/00216208:11320/20:10417773 - SOMHunter (2020)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/20:10417774 - SOMHunter for Lifelog Search (2020)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11320/20:10417777 - GigaSOM.jl: High-performance clustering and visualization of huge cytometry datasets (2020)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/21:10431050 - GPU-Accelerated Mahalanobis-Average Hierarchical Clustering Analysis (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11320/21:10432907 - On the User-centric Comparative Remote Evaluation of Interactive Video Search Systems (2021)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/21:10450952 - Video scene location recognition with neural networks (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11320/22:10438214 - PDBe-KB: collaboratively defining the biological context of structural data (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11320/22:10448337 - PrankWeb 3: accelerated ligand-binding site predictions for experimental and modelled protein structures (2022)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/22:10450929 - Neural-network-based estimation of normal distributions in black-box optimization (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216208:11320/22:10455491 - AHoJ: rapid, tailored search and retrieval of apo and holo protein structures for user-defined ligands (2022)
Výsledek druhu D	RIV/00216208:11320/23:10475619 - Heuristics for Opinion Diffusion via Local Elections (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14110/21:00121577 - Screening of Natural Compounds as P-Glycoprotein Inhibitors against Multidrug Resistance (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00118897 - Synthesis of Tetravalent Thio- and Selenogalactoside-Presenting Galactoclusters and Their Interactions with Bacterial Lectin PA-IL from Pseudomonas aeruginosa (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00118897 - Synthesis of Tetravalent Thio- and Selenogalactoside-Presenting Galactoclusters and Their Interactions with Bacterial Lectin PA-IL from Pseudomonas aeruginosa (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00118968 - Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae) and its adaptation to haematophagy as revealed by transcriptome and secretome profiling (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00118968 - Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae) and its adaptation to haematophagy as revealed by transcriptome and secretome profiling (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00119188 - SoluProt: prediction of soluble protein expression in Escherichia coli (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00119188 - SoluProt: prediction of soluble protein expression in Escherichia coli (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00119876 - Web-based tools for computational enzyme design (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/21:00119876 - Web-based tools for computational enzyme design (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00125998 - PDBe-KB: collaboratively defining the biological context of structural data (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126020 - Computer-aided engineering of staphylokinase toward enhanced affinity and selectivity for plasmin (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126021 - Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126021 - Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126167 - Tools for computational design and high-throughput screening of therapeutic enzymes (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126167 - Tools for computational design and high-throughput screening of therapeutic enzymes (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126323 - Fast approximative methods for study of ligand transport and rational design of improved enzymes for biotechnologies (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126323 - Fast approximative methods for study of ligand transport and rational design of improved enzymes for biotechnologies (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126323 - Fast approximative methods for study of ligand transport and rational design of improved enzymes for biotechnologies (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126367 - LoopGrafter: a web tool for transplanting dynamical loops for protein engineering (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126367 - LoopGrafter: a web tool for transplanting dynamical loops for protein engineering (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126370 - CalFitter 2.0: Leveraging the power of singular value decomposition to analyse protein thermostability (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126373 - Mechanism-Based Strategy for Optimizing HaloTag Protein Labeling (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126373 - Mechanism-Based Strategy for Optimizing HaloTag Protein Labeling (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126553 - Transcriptomic and proteomic profiling of peptidase expression in Fasciola hepatica eggs developing at host's body temperature (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126553 - Transcriptomic and proteomic profiling of peptidase expression in Fasciola hepatica eggs developing at host's body temperature (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00126840 - Mega-sized pericentromeric blocks of simple telomeric repeats and their variants reveal patterns of chromosome evolution in ancient Cycadales genomes (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127334 - OverProt: secondary structure consensus for protein families (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127350 - Towards a monophyletic classification of Cardueae: restoration of the genus Lophiolepis (= Cirsium p.p.) and new circumscription of Epitrachys (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127528 - Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127528 - Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127528 - Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127611 - Structural Insights into (Tere)phthalate-Ester Hydrolysis by a Carboxylesterase and Its Role in Promoting PET Depolymerization (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00127855 - Sex chromosome differentiation via changes in the Y chromosome repeat landscape in African annual killifishes Nothobranchius furzeri and N. kadleci (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00128314 - Advanced database mining of efficient haloalkane dehalogenases by sequence and structure bioinformatics and microfluidics (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00130114 - SoluProtMutDB: A manually curated database of protein solubility changes upon mutations (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00130114 - SoluProtMutDB: A manually curated database of protein solubility changes upon mutations (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/22:00130114 - SoluProtMutDB: A manually curated database of protein solubility changes upon mutations (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00130776 - Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00130776 - Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00130923 - Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00130923 - Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00131129 - Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00131129 - Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00131491 - In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00132030 - Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00132030 - Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/23:00132725 - Fast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes (2023)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/22:00126460 - Learned Indexing in Proteins: Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques (2022)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/22:00126488 - Large-scale randomness study of security margins for 100+ cryptographic functions (2022)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/22:00126488 - Large-scale randomness study of security margins for 100+ cryptographic functions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/23:00130033 - sMolBoxes: Dataflow Model for Molecular Dynamics Exploration (2023)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/23:00132045 - SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index (2023)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/23:00132045 - SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/20:00115952 - Atomic Charge Calculator II: web-based tool for the calculation of partial atomic charges (2020)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/20:00117701 - BinaryCIF and CIFTools-Lightweight, efficient and extensible macromolecular data management (2020)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/20:00117882 - High-performance macromolecular data delivery and visualization for the web (2020)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00118870 - Modes of Micromolar Host-Guest Binding of beta-Cyclodextrin Complexes Revealed by NMR Spectroscopy in Salt Water (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00118870 - Modes of Micromolar Host-Guest Binding of beta-Cyclodextrin Complexes Revealed by NMR Spectroscopy in Salt Water (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00120994 - CATH: increased structural coverage of functional space (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00121458 - Development of 48-condition buffer screen for protein stability assessment (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00121862 - Optimized SQE atomic charges for peptides accessible via a web application (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00122276 - NAChRDB: A Web Resource of Structure–Function Annotations to Unravel the Allostery of Nicotinic Acetylcholine Receptors (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00122430 - Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00122561 - Uncovering of cytochrome P450 anatomy by SecStrAnnotator (2021)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/21:00122676 - 2DProts: database of family-wide protein secondary structure diagrams (2021)
Výsledek druhu R	RIV/00216224:14740/22:00124983 - CoverView: clear atom-level visualization of electron density coverage of PDB structures to assist validation (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00126244 - Genome diploidization associates with cladogenesis, trait disparity, and plastid gene evolution (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00126244 - Genome diploidization associates with cladogenesis, trait disparity, and plastid gene evolution (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00128475 - Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00128476 - Fusion of two unrelated protein domains in a chimera protein and its 3D prediction: Justification of the x-ray reference structures as a prediction benchmark (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00128476 - Fusion of two unrelated protein domains in a chimera protein and its 3D prediction: Justification of the x-ray reference structures as a prediction benchmark (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00128561 - Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/22:00128561 - Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer (2022)
Výsledek druhu O	RIV/00216224:14740/22:00128659 - CF Day Meeting (2022)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/23:00130297 - Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/23:00130297 - Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/23:00132419 - Annotating Macromolecular Complexes in the Protein Data Bank: Improving the FAIRness of Structure Data (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/23:00133555 - GERONIMO: A tool for systematic retrieval of structural RNAs in a broad evolutionary context (2023)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/23:00133555 - GERONIMO: A tool for systematic retrieval of structural RNAs in a broad evolutionary context (2023)
Výsledek druhu J	RIV/28645413:_____/22:N0000002 - INLET RECIRCULATION IN PARTLOAD REGIMES – RADIAL PUMP (2022)
Výsledek druhu O	RIV/49777513:23220/22:43967408 - Thermal-Hydraulic Analysis of TEPLATOR Moderator Cooling System (2022)
Výsledek druhu G	RIV/49777513:23520/20:43960733 - MDR Sim (2020)
Výsledek druhu O	RIV/49777513:23520/20:43960735 - Summer School of Single Cell: from the lab to data analysis (2020)
Výsledek druhu O	RIV/49777513:23520/22:43967209 - Summer School of Single Cell: from the lab to data analysis (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/21:43903246 - Complex sequence organization of heterochromatin in the holocentric plant Cuscuta europaea elucidated by the computational analysis of nanopore reads (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/21:43903430 - Endosymbiont Capture, a Repeated Process of Endosymbiont Transfer with Replacement in Trypanosomatids Angomonas spp. (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/21:43903811 - Binding of de novo synthesized radiolabeled juvenile hormone (JH III) by JH receptors from the Cuban subterranean termite Prorhinotermes simplex and the German cockroach Blattella germanica (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/22:43904907 - Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/22:43904991 - Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/22:43904994 - Photochemistry of (Z)-Isovinylneoxanthobilirubic Acid Methyl Ester, a Bilirubin Dipyrrinone Subunit: Femtosecond Transient Absorption and Stimulated Raman Emission Spectroscopy (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/22:43905125 - Characterization of silk genes in Ephestia kuehniella and Galleria mellonella revealed duplication of sericin genes and highly divergent sequences encoding fibroin heavy chains (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/22:43905317 - Sex chromosome differentiation via changes in the Y chromosome repeat landscape in African annual killifishes Nothobranchius furzeri and N. kadleci (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/23:43906506 - Accumulation of retrotransposons contributes to W chromosome differentiation in the willow beauty Peribatodes rhomboidaria (Lepidoptera: Geometridae) (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/23:43906706 - Abandoning the Isochore Theory Can Help Explain Genome Compositional Organization in Fish (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60076658:12310/23:43907446 - Fast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/21:00546812 - Binding of de novo synthesized radiolabeled juvenile hormone (JH III) by JH receptors from the Cuban subterranean termite Prorhinotermes simplex and the German cockroach Blattella germanica (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/21:00548344 - Complex sequence organization of heterochromatin in the holocentric plant Cuscuta europaea elucidated by the computational analysis of nanopore reads (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/21:00555016 - Endosymbiont Capture, a Repeated Process of Endosymbiont Transfer with Replacement in Trypanosomatids Angomonas spp. (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/21:00555440 - The Mastigamoeba balamuthi Genome and the Nature of the Free-Living Ancestor of Entamoeba (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/22:00558708 - Fine structure and transcription dynamics of bread wheat ribosomal DNA loci deciphered by a multi-omics approach (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/22:00564193 - Sex chromosome differentiation via changes in the Y chromosome repeat landscape in African annual killifishes Nothobranchius furzeri and N. kadleci (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/22:00564648 - Characterization of silk genes in Ephestia kuehniella and Galleria mellonella revealed duplication of sericin genes and highly divergent sequences encoding fibroin heavy chains (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/22:00568618 - Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/22:00568619 - The ecology of palm genomes: repeat-associated genome size expansion is constrained by aridity (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/23:00566784 - Accumulation of retrotransposons contributes to W chromosome differentiation in the willow beauty Peribatodes rhomboidaria (Lepidoptera: Geometridae) (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/23:00571900 - The giant diploid faba genome unlocks variation in a global protein crop (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/23:00584200 - Genomics and biochemical analyses reveal a metabolon key to β-L-ODAP biosynthesis in Lathyrus sativus (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/23:00584246 - Assembly of the 81.6 Mb centromere of pea chromosome 6 elucidates the structure and evolution of metapolycentric chromosomes (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60077344:_____/23:00584248 - Disruption of the standard kinetochore in holocentric Cuscuta species (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22310/20:43921722 - Single-Cell RNA Sequencing Unravels Heterogeneity of the Stromal Niche in Cutaneous Melanoma Heterogeneous Spheroids (2020)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22310/21:43923204 - Structural Basis of the Function of Yariv Reagent - An Important Tool to Study Arabinogalactan Proteins (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22310/22:43924445 - Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22310/22:43925547 - Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22310/23:43927159 - Solicola gregarius gen. nov., sp. nov., a soil actinobacterium isolated after enhanced cultivation with Micrococcus luteus culture supernatant (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22320/22:43924315 - Genomic analysis of Acinetobacter pittii CEP14 reveals its extensive biodegradation capabilities, including cometabolic degradation of cis-1,2-dichloroethene (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/21:43921978 - Exploring the Potential of Micrococcus luteus Culture Supernatant With Resuscitation-Promoting Factor for Enhancing the Culturability of Soil Bacteria (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/21:43922218 - Predominant Biphenyl Dioxygenase From Legacy Polychlorinated Biphenyl (PCB)-Contaminated Soil Is a Part of Unusual Gene Cluster and Transforms Flavone and Flavanone (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/21:43923204 - Structural Basis of the Function of Yariv Reagent - An Important Tool to Study Arabinogalactan Proteins (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924303 - Culturomics of Bacteria from Radon-Saturated Water of the World’s Oldest Radium Mine (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924313 - Prokaryotes of renowned Karlovy Vary (Carlsbad) thermal springs: phylogenetic and cultivation analysis (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924315 - Genomic analysis of Acinetobacter pittii CEP14 reveals its extensive biodegradation capabilities, including cometabolic degradation of cis-1,2-dichloroethene (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924316 - Pedomonas mirosovicensis gen. nov., sp. nov., a bacterium isolated from soil with the aid of Micrococcus luteus culture supernatant containing resuscitation-promoting factor. (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924317 - Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924443 - Collective Variable for Metadynamics Derived From AlphaFold Output (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924445 - Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/22:43924555 - Analysis of the Results of Metadynamics Simulations by metadynminer and metadynminer3d (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/23:43926638 - Legacy Effects of Phytoremediation on Plant-Associated Prokaryotic Communities in Remediated Subarctic Soil Historically Contaminated with Petroleum Hydrocarbons (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22330/23:43927159 - Solicola gregarius gen. nov., sp. nov., a soil actinobacterium isolated after enhanced cultivation with Micrococcus luteus culture supernatant (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/21:43921935 - Interaction of Ag with corannulene: Experimental and theoretical study (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/21:43922121 - Importance of one- and two-photon transitions in the strong-field dissociation of NO2 (2021)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/22:43923878 - Direct evidence of the dominant role of multiphoton permanent-dipole transitions in strong-field dissociation of NO2+ (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/22:43923939 - Cation–π interaction of thallium (I) with [7]helicene: an experimental and theoretical study (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/22:43923999 - Millimeter wave spectrum and search for vinyl isocyanate toward Sgr B2(N) with ALMA (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/22:43924459 - Interaction of the Silver(I) Cation with [2.2]Paracyclophane: Experimental and Theoretical Study (2022)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22340/23:43925214 - Rotational Fingerprints of Vinylketene for Astronomical Observations (2023)
Výsledek druhu J	RIV/60461373:22810/22:43923939 - Cation–π interaction of thallium (I) with [7]helicene: an experimental and theoretical study (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/20:00531246 - A Comparison of Protein and mRNA Expression during Development of the Soil Dwelling Prokaryote (S. coelicolor) (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/20:00534616 - Bacterial nanotubes as a manifestation of cell death (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/20:00535511 - GigaSOM.jl: High-performance clustering and visualization of huge cytometry datasets (2020)
Výsledek druhu M	RIV/61388963:_____/20:00539262 - ELIXIR CZ Annual Conference 2020 (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/21:00542750 - IDSM ChemWebRDF: SPARQLing small-molecule datasets (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/21:00544133 - Amino Acid Interactions (INTAA) web server v2.0: a single service for computation of energetics and conservation in biomolecular 3D structures (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/21:00544133 - Amino Acid Interactions (INTAA) web server v2.0: a single service for computation of energetics and conservation in biomolecular 3D structures (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/21:00546812 - Binding of de novo synthesized radiolabeled juvenile hormone (JH III) by JH receptors from the Cuban subterranean termite Prorhinotermes simplex and the German cockroach Blattella germanica (2021)
Výsledek druhu M	RIV/61388963:_____/21:00553872 - ELIXIR CZ Annual Conference 2021 (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/21:00556414 - Molecular dynamics simulations provide structural insight into binding of cyclic dinucleotides to human STING protein (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/22:00551188 - Supernova: A Deoxyribozyme that Catalyzes a Chemiluminescent Reaction (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/22:00559092 - Transcriptomic and proteomic profiling of peptidase expression in Fasciola hepatica eggs developing at host’s body temperature (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/22:00559536 - Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/22:00559713 - Fusion of two unrelated protein domains in a chimera protein and its 3D prediction: Justification of the x-ray reference structures as a prediction benchmark (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/22:00564064 - The LOTUS initiative for open knowledge management in natural products research (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/22:00565346 - Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/23:00569875 - Proteases and their inhibitors involved in Schistosoma mansoni egg-host interaction revealed by comparative transcriptomics with Fasciola hepatica eggs (2023)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/23:00573624 - A comparison of approaches to accessing existing biological and chemical relational databases via SPARQL (2023)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/20:00531246 - A Comparison of Protein and mRNA Expression during Development of the Soil Dwelling Prokaryote (S. coelicolor) (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/20:00534616 - Bacterial nanotubes as a manifestation of cell death (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/20:00537847 - MicroRNA dilution during oocyte growth disables the microRNA pathway in mammalian oocytes (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/21:00541594 - Kinetic Modeling and Meta-Analysis of the Bacillus subtilis SigB Regulon during Spore Germination and Outgrowth (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/21:00547151 - Probabilistic outlier identification for RNA sequencing generalized linear models (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/21:00549337 - Predominant Biphenyl Dioxygenase From Legacy Polychlorinated Biphenyl (PCB)-Contaminated Soil Is a Part of Unusual Gene Cluster and Transforms Flavone and Flavanone (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/21:00550106 - Disease progression of 213 patients hospitalized with Covid-19 in the Czech Republic in March-October 2020: An exploratory analysis (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00557064 - Nicotinic Acetylcholine Receptors Expressed by Striatal Interneurons Inhibit Striatal Activity and Control Striatal-Dependent Behaviors (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00558580 - Ms1 RNA Interacts With the RNA Polymerase Core in Streptomyces coelicolor and Was Identified in Majority of Actinobacteria Using a Linguistic Gene Synteny Search (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00558832 - Hypertransglycosylating Variants of the GH20 beta-N-Acetylhexosaminidase for the Synthesis of Chitooligomers (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00560516 - Clinical prediction models for mortality in patients with covid-19: external validation and individual participant data meta-analysis (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00562220 - Selective footprinting of 40S and 80S ribosome subpopulations (Sel-TCP-seq) to study translation and its control (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00565503 - Quantitative Aspect of Bacillus subtilis σB Regulatory Network—A Computational Simulation (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00565771 - Pedomonas mirosovicensis gen. nov., sp. nov., a bacterium isolated from soil with the aid of Micrococcus luteus culture supernatant containing resuscitation-promoting factor (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/22:00566474 - Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/23:00571301 - Retinitis pigmentosa-associated mutations in mouse Prpf8 cause misexpression of circRNAs and degeneration of cerebellar granule cells (2023)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/23:00574682 - Solicola gregarius gen. nov., sp. nov., a soil actinobacterium isolated after enhanced cultivation with Micrococcus luteus culture supernatant (2023)
Výsledek druhu J	RIV/61388971:_____/23:00582513 - Relationship between Functional Capacity and Medication Adherence in Heart Failure (2023)
Výsledek druhu W	RIV/61989592:15110/20:73604128 - 5th Advanced in silico Drug Design workshop/challenge 2020 (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15110/21:73607433 - Benchmarks for interpretation of QSAR models (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15110/23:73621172 - Relationship between Functional Capacity and Medication Adherence in Heart Failure (2023)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15110/23:73621996 - EasyDock: customizable and scalable docking tool (2023)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/20:73603954 - High-performance macromolecular data delivery and visualization for the web (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/20:73604015 - Atomic Charge Calculator II: web-based tool for the calculation of partial atomic charges (2020)
Výsledek druhu W	RIV/61989592:15310/20:73604128 - 5th Advanced in silico Drug Design workshop/challenge 2020 (2020)
Výsledek druhu R	RIV/61989592:15310/20:73604746 - Molmedb - database about interactions of molecules with membranes (2020)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73608962 - Genetic structure of endangered species Adenophora liliifolia and footprints of postglacial recolonisation in Central Europe (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73609171 - Uncovering of cytochrome P450 anatomy by SecStrAnnotator (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73609294 - 2DProts: database of family-wide protein secondary structure diagrams (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73609387 - CATH: increased structural coverage of functional space (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73609389 - Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73610418 - Optimized SQE atomic charges for peptides accessible via a web application (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/21:73610442 - Synthesis of dihydrotestosterone derivatives modified in the A-ring with (hetero)arylidene, pyrazolo[1,5-a]pyrimidine and triazolo[1,5-a] pyrimidine moieties and their targeting of the androgen receptor in prostate cancer (2021)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/22:73610275 - A complete search of combinatorial peptide library greatly benefited from probabilistic incorporation of prior knowledge (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/22:73610278 - Evaluation of an integrative Bayesian peptide detection approach on a combinatorial peptide library (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/22:73611091 - PDBe-KB: collaboratively defining the biological context of structural data (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/22:73614001 - OverProt: secondary structure consensus for protein families (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/22:73615705 - Novel heterocyclic hydroxamates as inhibitors of the mycobacterial zinc metalloprotease Zmp1 to probe its mechanism of function (2022)
Výsledek druhu J	RIV/61989592:15310/23:73620978 - The giant diploid faba genome unlocks variation in a global protein crop (2023)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/20:00535707 - A rapid approach for in locus overexpression of Trypanosoma brucei proteins (2020)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/20:00537847 - MicroRNA dilution during oocyte growth disables the microRNA pathway in mammalian oocytes (2020)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/20:00539639 - Single-Cell RNA Sequencing Unravels Heterogeneity of the Stromal Niche in Cutaneous Melanoma Heterogeneous Spheroids (2020)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/21:00549337 - Predominant Biphenyl Dioxygenase From Legacy Polychlorinated Biphenyl (PCB)-Contaminated Soil Is a Part of Unusual Gene Cluster and Transforms Flavone and Flavanone (2021)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/21:00550770 - High Cysteine Diet Reduces Insulin Resistance in SHR-CRP Rats (2021)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/21:00554631 - Right versus left ventricular remodeling in heart failure due to chronic volume overload (2021)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/21:00554710 - Maternal genetic origin of the late and final Neolithic human populations from present-day Poland (2021)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/21:00555440 - The Mastigamoeba balamuthi Genome and the Nature of the Free-Living Ancestor of Entamoeba (2021)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00558018 - M-CSFR/CSF1R signaling regulates myeloid fates in zebrafish via distinct action of its receptors and ligands (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00559170 - Nicotinic Acetylcholine Receptors Expressed by Striatal Interneurons Inhibit Striatal Activity and Control Striatal-Dependent Behaviors (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00559232 - FBXO38 Ubiquitin Ligase Controls Centromere Integrity via ZXDA/B Stability (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00559438 - Genomic analysis of Acinetobacter pittii CEP14 reveals its extensive biodegradation capabilities, including cometabolic degradation of cis-1,2-dichloroethene (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00559536 - Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00564648 - Characterization of silk genes in Ephestia kuehniella and Galleria mellonella revealed duplication of sericin genes and highly divergent sequences encoding fibroin heavy chains (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00565126 - The Role of IL-6 in Cancer Cell Invasiveness and Metastasis-Overview and Therapeutic Opportunities (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00566161 - Two complementary approaches for efficient isolation of Sertoli cells for transcriptomic analysis (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00566474 - Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/22:00567393 - Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/23:00571301 - Retinitis pigmentosa-associated mutations in mouse Prpf8 cause misexpression of circRNAs and degeneration of cerebellar granule cells (2023)
Výsledek druhu J	RIV/68378050:_____/23:00574419 - Scdrake: a reproducible and scalable pipeline for scRNA-seq data analysis (2023)
Výsledek druhu J	RIV/68407700:21240/21:00352396 - Application Profile for Machine-Actionable Data Management Plans (2021)
Výsledek druhu R	RIV/68407700:21240/21:00356718 - Data Stewardship Wizard (2021)
Výsledek druhu J	RIV/68407700:21240/22:00358972 - DCSO: Towards an Ontology for Machine-Actionable Data Management Plans (2022)
Výsledek druhu J	RIV/68407700:21240/22:00359605 - Proof of Concept and Horizons on Deployment of FAIR Data Points in the COVID-19 Pandemic (2022)
Výsledek druhu J	RIV/86652036:_____/20:00535402 - A unified dinucleotide alphabet describing both RNA and DNA structures (2020)
Výsledek druhu J	RIV/86652036:_____/20:00535408 - Structural alphabets for conformational analysis of nucleic acids available at dnatco.datmos.org (2020)
Výsledek druhu J	RIV/86652036:_____/21:00556414 - Molecular dynamics simulations provide structural insight into binding of cyclic dinucleotides to human STING protein (2021)
Výsledek druhu J	RIV/86652036:_____/22:00560262 - Knowledge-based prediction of DNA hydration using hydrated dinucleotides as building blocks (2022)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků	V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky	Velká výzkumná infrastruktura poskytovala služby vědecké komunitě z ČR i zahraničí v souladu s cíli projektu a zajišťovala účast České republiky v nadnárodních strukturách. Jak výkonem svých služeb na domácí půdě, tak svým mezinárodním přesahem projekt zcela naplnil své poslání.