Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníIAA1065203 - Využití kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu (2002-2006, AV0/IA)

Identifikační kód	IAA1065203
Důvěrnost údajů	S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce	Využití kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu
Název projektu anglicky	The use of combination of laser microbeam and cytometric techniques in the study of the structure and dynamics of human genome
Poskytovatel	AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR )
Program	IA - Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR  (1991 - 2013)
Kategorie VaV	ZV - Základní výzkum
Hlavní obor - skupina	B - Fyzika a matematika
Hlavní obor	BO - Biofyzika
Vedlejší obor	BH - Optika, masery a lasery
Další vedlejší obor	EB - Genetika a molekulární biologie
Zahájení řešení	2002
Ukončení řešení	2006
Datum posledního uvolnění účelové podpory	-
Číslo smlouvy	-
Poslední stav řešení	U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
Kčtis. Kč ** Finance projektu 2002 2003 2004 2005 2006 celkem Výše podpory z národních zdrojů 772 000,00772 783 000,00783 737 000,00737 742 000,00742 752 000,00752 3 786 000,003786 Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Ostatní veřejné zdroje financování - - - - - 2 130 000,002130 Celkové uznané náklady 1 869 000,001869 1 816 000,001816 737 000,00737 742 000,00742 752 000,00752 5 916 000,005916 Typ čerpané čerpané čerpané čerpané čerpané ** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa *** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů » Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů 2002 2003 2004 2005 2006 celkem Finance 772 000,00772 783 000,00783 737 000,00737 742 000,00742 752 000,00752 3 786 000,003786
Druh soutěže	VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích	SAV02002-AB - Veřejná soutěž (AV0/IA)
Cíle řešení v původním jazyce	Podstatou projektu je využít metod a experimentálních sestav optické pinzety, optického skalpelu a automatizovaného cytometru, které byly vyvinuty za finanční podpory předcházejících projektů, ke studiu mechanických vlastností a uspořádání interfázního chromatinu v jádrech živých i fixovaných lidských buněk. Teoretické a experimentální zkušenosti interdisciplinárního týmu řešitelů budou využity: - k fluorescenčnímu barvení chromatinu živých buněk, - k laserem indukované fúzi živých fluorescenčně označených buněk, - k topologické analýze rozložení obarvené oblasti chromatinu v jádrech živých a fixovaných buněk, - ke vnášení fluorescenčně obarvených nanosond do jádra živé buňky, optickému zachycení sondy a vymezení prostoru, který je pro sondu nedostupný, s mikrometrovým rozlišením, - ke studiu mechanických vlastností chromatinu s využitím optických manipulací s vhodnými sondami. Získané poznatky budou využity pro vývoj nových diagnostických metod.
Cíle řešení v anglickém jazyce	The aim of the project is to use the methods and experimental systems of optical tweezers, optical scalpel, and automated cytometer, that were developed using the finantial support of the previous scientific projects, for the study of the mechanical properties and arrangement of the interphase chromatin in the nuclei of living and fixed human cells. Theoretical and experimental experiences of the interdisciplinary team of applicants will be used for: - fluorescence labelling of chromatin in living cells, - laser induced fusion of labelled cells, - topologic analyses of the dye distribution inside living and fixed cells, - insertion of dyed nanoparticle into the living cell nucleus, optical confinement of this probe and detection of the region which isnot accesible for the probe, - study of the mechanical properties of the chromatin using optical trapping of suitable probes. The knowledge obtained by these techniques will be used for development of new diagnostic methods.
Klíčová slova v anglickém jazyce	optical-tweezers; optical-scalpel; high-resolution-cytometer; confocal- microscopy; chromatin-structure; nuclear-structure; chromosome-domains; chromosome-aberrations; human-genome; genomics; diagnostics-in-oncology; cell-fusion; image-analyses
Kontrolní číslo stavu projektu v letech	2002: 725453 2003: 961368 2004: 1306691 2005: 1650338 2006: 33507626 2007: 2586276
Datum dodání posledního záznamu o projektu	03.04.2009
Systémové označení dodávky dat	CEP07-AV0-IA-U/03:3

Účastníci projektu

Počet příjemců	0
Počet dalších účastníků projektu	4

Další účastník projektu	Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Další účastník projektu	Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.

Další účastník projektu	Masarykova univerzita / Fakulta informatiky

Další účastník projektu	Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství

Kčtis. Kč **

Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady	2002	2003	2004	2005	2006
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Výše podpory z národních zdrojů	2002	2003	2004	2005	2006
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů	2002	2003	2004	2005	2006
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce	2002	2003	2004	2005	2006
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka během jednotlivých let	2002	2003	2004	2005	2006
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem	74
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/02:00006233 - Spatial distribution of centromeric and subtelomeric DNA sequences in interphase nuclei of human Go and stimulated lymphocytes (2002)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/02:00006233 - Spatial distribution of centromeric and subtelomeric DNA sequences in interphase nuclei of human Go and stimulated lymphocytes (2002)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/02:00006557 - The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei (2002)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/02:00006557 - The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei (2002)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/02:00006557 - The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei (2002)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/03:00009644 - Detailed studies of the human genome 3D structure (2003)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/03:00009644 - Detailed studies of the human genome 3D structure (2003)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/04:00009648 - Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium (2004)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/04:00009648 - Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium (2004)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/04:00009648 - Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009698 - Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009698 - Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009698 - Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009703 - Methylation of histone H3K9 in human blood cells and in granulocytes of patients with myeloid leukemia (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009703 - Methylation of histone H3K9 in human blood cells and in granulocytes of patients with myeloid leukemia (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009705 - Dynamics of HP1 transgene loci movement and silencing in living cells (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009705 - Dynamics of HP1 transgene loci movement and silencing in living cells (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009707 - In vivo imaging of cell interior using automated high-resolution cytometry (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009707 - In vivo imaging of cell interior using automated high-resolution cytometry (2004)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/04:00009707 - In vivo imaging of cell interior using automated high-resolution cytometry (2004)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/05:00012357 - Methylation of histones in myeloid leukemias as a potential marker of granulocyte abnormalities (2005)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/05:00012357 - Methylation of histones in myeloid leukemias as a potential marker of granulocyte abnormalities (2005)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/05:00012357 - Methylation of histones in myeloid leukemias as a potential marker of granulocyte abnormalities (2005)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/06:00015327 - Optical tracking of microobjects within living cells (2006)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/06:00015327 - Optical tracking of microobjects within living cells (2006)
Výsledek druhu D	RIV/00216224:14330/06:00015327 - Optical tracking of microobjects within living cells (2006)
Výsledek druhu O	RIV/00216224:14330/06:00024118 - Analýza lokalizace a interakce fluorescenčně značených molekul v živých i fixovaných lidských buňkách. (2006)
Výsledek druhu O	RIV/00216224:14330/06:00024118 - Analýza lokalizace a interakce fluorescenčně značených molekul v živých i fixovaných lidských buňkách. (2006)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14330/06:00040619 - Directional motion of foreign plasmid DNA to nuclear HP1 foci (2006)
Výsledek druhu J	RIV/00216305:26210/03:PU48389 - Transmisní holografická konfokální mikroskopie (2003)
Výsledek druhu J	RIV/00216305:26210/03:PU48391 - Měření povrchů holografickým konfokálním mikroskopem (2003)
Výsledek druhu J	RIV/00216305:26210/04:PU48386 - Transmisní holografický mikroskop pro polychromatické světlo: návrh optické soustavy a vlastnosti zobrazení (2004)
Výsledek druhu S	RIV/00216305:26210/06:PR22413 - Digitální holografický mikroskop pro procházejcí světlo s nízkou koherencí (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/02:17023171 - The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei. (2002)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/02:17023171 - The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei. (2002)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/04:00104661 - Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium (2004)
Výsledek druhu D	RIV/68081707:_____/04:00108436 - Methylation of histone H3K9 in human blood cells and in granulocytes of patients with myeloid leukemia (2004)
Výsledek druhu D	RIV/68081707:_____/04:00108438 - Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells (2004)
Výsledek druhu D	RIV/68081707:_____/04:00108481 - In vivo imaging of cell interior using automated high-resolution cytometry (2004)
Výsledek druhu D	RIV/68081707:_____/04:00108483 - Dynamics of HP1 transgene loci movement and silencing in living cells (2004)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/05:00001090 - Methylation of histones in myeloid leukemias as a potential marker of granulocyte abnormalities (2005)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00040581 - Simple procedure for automatic detection of unstable alleles in the myotonic dystrophy and Huntington's disease loci (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00047638 - Directional motion of foreign plasmid DNA to nuclear HP1 foci (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00075900 - Comparative transcriptome maps: a new approach to the diagnosis of colorectal carcinoma patients using cDNA microarrays (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00086768 - Chromatin dynamics during DSB repair (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00317680 - Local changes of higher-order chromatin structure during DSB-repair (2008)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/01:12020138 - Study of mechanical properties and dynamics of biomembranes and single molecules with the use of laser beam - an overview. (2001)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/01:12020138 - Study of mechanical properties and dynamics of biomembranes and single molecules with the use of laser beam - an overview. (2001)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/02:12030014 - Spatial structure of chromatin in hybrid cells produced by laser induced fusion studied by optical microscopy. (2002)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/03:00100020 - Employment of an optically trapped probe for the study of tiny force interactions at the molecular level - an overview (2003)
Výsledek druhu J	RIV/68081731:_____/03:12030003 - Využití více opticky zachycených sond pro měření profilů nepřístupných průhledných povrchů. (2003)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/03:12030071 - Optical tweezers and its use in local probe microscopy. (2003)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/03:12030097 - Employment of laser induced fusion of living cells for the study of spatial structure of chromatin. (2003)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/04:00109082 - Behaviour of colloidal microparticles in a planar 3-beam interference field (2004)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/04:00109083 - How the size of a particle approaching dielectric interface influences its behavior (2004)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/04:00109084 - Optical trapping in counter-propagating Bessel beams (2004)
Výsledek druhu J	RIV/68081731:_____/05:00022383 - Two- and three-beam interferometric optical tweezers (2005)
Výsledek druhu J	RIV/68081731:_____/05:00022391 - Optical conveyor belt for delivery of submicron objects (2005)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/05:00022537 - Behavior of submicron colloids in two-dimensional optical lattice (2005)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/05:00022540 - Sub-micron particle delivery using evanescent field (2005)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/05:00022542 - How the stiffness of the optical trap depends on the proximity of the dielectric interface (2005)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/05:00022543 - Behavior of microparticles in laser interference field (2005)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/05:00022551 - Effect of laser irradiation on the ultrastructure of protozoa (2005)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/05:00022596 - Optical conveyor belt based on Bessel beams (2005)
Výsledek druhu J	RIV/68081731:_____/06:00043771 - Optical forces generated by evanescent standing waves and their usage for sub-micron particle delivery (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081731:_____/06:00044152 - Optical sorting and detection of submicrometer objects in a motional standing wave (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00048847 - Measurement of surface details with nanometer resolution using several optically held probes (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00048848 - Optical conveyor belt for delivery of sub-micron objects (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00048849 - Behavior of colloidal microparticles in interference field created by several laser beams (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00048851 - Optical tracking of microobjects within living cells (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081731:_____/06:00049041 - Laboratoř optických mikromanipulačních technik ÚPT AV ČR (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00051337 - Optical interference fields: an excellent tool kit to study Brownian dynamics (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00051340 - Precise determination of object position in 1D optical lattice (2006)
Výsledek druhu D	RIV/68081731:_____/06:00051344 - Sub-micron scale Brownian swimmer or surfer in one dimensional standing wave optical traps (2006)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků	U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky	Projekt přinesl zásadní poznatky o prostorovém uspořádání a dynamice jaderného chromatinu. Byly nalezeny originální metody pro optické manipulace s velkými počty objektů, jejich třídění a pro pozorování rozložení indexu lomu v živých objektech.