Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Centrální evidence projektů

Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGBP501/12/G090 - Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin (2012-2018, GA0/GB)

Identifikační kód GBP501/12/G090
Důvěrnost údajů S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin
Název projektu anglicky Evolution and Function of Complex Plant Genomes
Poskytovatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Program GB - Projekty na podporu excelence v základním výzkumu  (2012 - 2018)
Kategorie VaV ZV - Základní výzkum
Hlavní obor - skupina E - Biovědy
Hlavní obor EB - Genetika a molekulární biologie
Vedlejší obor EF - Botanika
Další vedlejší obor GE - Šlechtění rostlin
Zahájení řešení 01.01.2012
Ukončení řešení 31.12.2018
Datum posledního uvolnění účelové podpory 16.05.2018
Číslo smlouvy P501-12-G090
Poslední stav řešení U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
Kčtis. Kč **
Finance projektu		2012201320142015201620172018celkem
Výše podpory z národních zdrojů10 903 000,001090311 562 000,001156212 142 000,001214212 697 000,001269713 232 000,001323213 778 000,001377814 247 000,001424788 561 000,0088561
Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů ***0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Celkové uznané náklady10 903 000,001090311 562 000,001156212 142 000,001214212 697 000,001269713 232 000,001323213 778 000,001377814 247 000,001424788 561 000,0088561
Typčerpanéčerpanéčerpanéčerpanéčerpanéčerpanéčerpané

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020

Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »
Druh soutěže VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích SGA02012GA-GB - Veřejná soutěž (GA0/GB)
Cíle řešení v původním jazyce Tento projekt by měl přispět k vyšší kompetitivnosti české vědy v oblasti genetiky rostlin. Bude studována zejména problematika struktury a dynamiky genomu, otázky polyploidie a hybridizace jako potenciálu k pochopení biodiverzity a evoluce druhů, genetického složení a funkce specifických rostlinných chromozomů (pohlavní chromozomy a B chromozomy) a pochopení epigenetických procesů realizujících rostlinný fenotyp. Protože možnosti dnešní molekulární biologie jsou dány novými technologiemi, naše laboratoře vytvoří analytickou síť komplexní genomové analýzy, která bude sloužit nejen k vlastnímu výzkumu, ale bude sdílena i s příslušnými vysokými školami a jejich studenty. Náš výzkum přinese především nové originální poznatky publikované v prestižních vědeckých časopisech, některé údaje genetických map získané u kulturních plodin budou aplikovány ve šlechtění a projekt se stane centrem pro studenty a začínající vědecké pracovníky. Tento projekt je přímým a navazujícím pokračováním grantu MŠMT LC 06004 "Integrovaný výzkum rostlinného genomu" (koordinátor prof. Vyskot, 2006-2011).
Cíle řešení v anglickém jazyce The project aims at combining experience, skills and advanced methodologies of five research teams in order to accelerate scientific competitiveness of the Czech Republic in the filed of plant genomics. Since modern biology is increasingly driven by technology, the project will greatly benefit by tight integration of state-of-the-art methods and instruments provided by the participating teams. The proposed research will bring new knowledge on the structure, evolution and function of complex plant genomes, mainly focusing on (1) consequences of hybridization and polyploidization; (2) evolution and function of specialized chromosomes; (3) role of repetitive sequences in shaping plant genomes and their compartments; (4) evolutionary significance of epigenetic information; and (5) karyotype changes accompanying evolution and speciation. Although the project has no ambitions of immediate application outputs, its results will provide a basis for future applications of genomics tools in breeding improved cultivars of agricultural crops.
Klíčová slova v anglickém jazyce plant genome polyploidy interspecific hybrids transposons sex chromosomes
Kontrolní číslo stavu projektu v letech 2012: 189293873
2013: 190434471
2014: 184596186
2015: 187874368
2016: 190639096 ( v1.0 )
2017: 190674902 ( v1.0 )
2018: 190684731 ( v1.0 )
2019: 190711666 ( v2.0 )
Datum dodání posledního záznamu o projektu 24.02.2020
Systémové označení dodávky dat CEP19-GA0-GB-U/02:1

Účastníci projektu

Počet příjemců 4
Počet dalších účastníků projektu 0
Příjemce Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Řešitelprof. RNDr. Boris Vyskot, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 2696762)
Příjemce Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
ŘešitelRNDr. Jiří Macas, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5717817)
Příjemce Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Řešitelprof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 1800477)
Příjemce Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
ŘešitelDoc. Mgr. Martin Lysák, Ph.D. DSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3881741)

Kčtis. Kč **
Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady2012201320142015201620172018
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.4 686 000,0046864 902 000,0049025 158 000,0051585 393 000,0053935 661 000,0056615 945 000,0059456 241 000,006241
Biologické centrum AV ČR, v.v.i.1 881 000,0018811 895 000,0018951 990 000,0019902 113 000,0021132 190 000,0021902 297 000,0022972 322 000,002322
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut1 636 000,0016361 931 000,0019312 021 000,0020212 091 000,0020912 136 000,0021362 163 000,0021632 172 000,002172
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.2 700 000,0027002 834 000,0028342 973 000,0029733 100 000,0031003 245 000,0032453 373 000,0033733 512 000,003512
Výše podpory z národních zdrojů2012201320142015201620172018
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.4 686 000,0046864 902 000,0049025 158 000,0051585 393 000,0053935 661 000,0056615 945 000,0059456 241 000,006241
Biologické centrum AV ČR, v.v.i.1 881 000,0018811 895 000,0018951 990 000,0019902 113 000,0021132 190 000,0021902 297 000,0022972 322 000,002322
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut1 636 000,0016361 931 000,0019312 021 000,0020212 091 000,0020912 136 000,0021362 163 000,0021632 172 000,002172
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.2 700 000,0027002 834 000,0028342 973 000,0029733 100 000,0031003 245 000,0032453 373 000,0033733 512 000,003512
Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů2012201320142015201620172018
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Biologické centrum AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce2012201320142015201620172018
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Biologické centrum AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,0000,0000,000

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem 181
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/12:00057133 - Whole-genome triplication and species radiation in the southern African tribe Heliophileae (Brassicaceae) (2012)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/12:00057133 - Whole-genome triplication and species radiation in the southern African tribe Heliophileae (Brassicaceae) (2012)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/12:00057133 - Whole-genome triplication and species radiation in the southern African tribe Heliophileae (Brassicaceae) (2012)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/12:00058667 - The key role of repeated DNAs in sex chromosome evolution in two fish species with ZW sex chromosome system (2012)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/12:00058667 - The key role of repeated DNAs in sex chromosome evolution in two fish species with ZW sex chromosome system (2012)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066451 - Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066451 - Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066452 - Massive genomic variation and strong selection in Arabidopsis thaliana lines from Sweden (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066453 - The Capsella rubella genome and the genomic consequences of rapid mating system evolution (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066453 - The Capsella rubella genome and the genomic consequences of rapid mating system evolution (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066454 - An atlas of over 90,000 conserved noncoding sequences provides insight into crucifer regulatory regions (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/13:00066454 - An atlas of over 90,000 conserved noncoding sequences provides insight into crucifer regulatory regions (2013)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/14:00074133 - Live and let die: centromere loss during evolution of plant chromosomes (2014)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/14:00074133 - Live and let die: centromere loss during evolution of plant chromosomes (2014)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/14:00074135 - When fathers are instant losers: homogenization of rDNA loci in recently formed Cardamine X schulzii trigenomic allopolyploid (2014)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/14:00074135 - When fathers are instant losers: homogenization of rDNA loci in recently formed Cardamine X schulzii trigenomic allopolyploid (2014)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/14:00074437 - The X Chromosome Is Necessary for Somatic Development in the Dioecious Silene latifolia: Cytogenetic and Molecular Evidence and Sequencing of a Haploid Genome (2014)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081227 - Chromatin organization and cytological features of carnivorous Genlisea species with large genome size differences (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081227 - Chromatin organization and cytological features of carnivorous Genlisea species with large genome size differences (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081228 - Genome Structure of the Heavy Metal Hyperaccumulator Noccaea caerulescens and Its Stability on Metalliferous and Nonmetalliferous Soils (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081228 - Genome Structure of the Heavy Metal Hyperaccumulator Noccaea caerulescens and Its Stability on Metalliferous and Nonmetalliferous Soils (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081229 - Karyotype evolution in apomictic Boechera and the origin of the aberrant chromosomes (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081229 - Karyotype evolution in apomictic Boechera and the origin of the aberrant chromosomes (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081230 - Catastrophic chromosomal restructuring during genome elimination in plants (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081230 - Catastrophic chromosomal restructuring during genome elimination in plants (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081441 - Analysis of the giant genomes of Fritillaria (Liliaceae) indicates that a lack of DNA removal characterizes extreme expansions in genome size (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081444 - Genome expansion of Arabis alpina linked with retrotransposition and reduced symmetric DNA methylation (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081444 - Genome expansion of Arabis alpina linked with retrotransposition and reduced symmetric DNA methylation (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081701 - Centromere and telomere sequence alterations reflect the rapid genome evolution within the carnivorous plant genus Genlisea (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081701 - Centromere and telomere sequence alterations reflect the rapid genome evolution within the carnivorous plant genus Genlisea (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081702 - Comparative Genome Analysis Reveals Divergent Genome Size Evolution in a Carnivorous Plant Genus (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/15:00081702 - Comparative Genome Analysis Reveals Divergent Genome Size Evolution in a Carnivorous Plant Genus (2015)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00087797 - chromDraw: an R package for visualization of linear and circular karyotypes (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00087797 - chromDraw: an R package for visualization of linear and circular karyotypes (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088694 - Comparative paleogenomics of crucifers: ancestral genomic blocks revisited (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088725 - Chromosome Preparation for Cytogenetic Analyses in Arabidopsis (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095153 - Monophyletic Origin and Evolution of the Largest Crucifer Genomes (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095153 - Monophyletic Origin and Evolution of the Largest Crucifer Genomes (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095154 - Epistatic and allelic interactions control expression of ribosomal RNA gene clusters in Arabidopsis thaliana (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095157 - Unstable Inheritance of 45S rRNA Genes in Arabidopsis thaliana (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095158 - The Mediterranean: the cradle of Anthoxanthum (Poaceae) diploid diversity (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095490 - Multispeed genome diploidization and diversification after an ancient allopolyploidization (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095490 - Multispeed genome diploidization and diversification after an ancient allopolyploidization (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101417 - The Aquilegia genome provides insight into adaptive radiation and reveals an extraordinarily polymorphic chromosome with a unique history (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101417 - The Aquilegia genome provides insight into adaptive radiation and reveals an extraordinarily polymorphic chromosome with a unique history (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101418 - Hybridization-facilitated genome merger and repeated chromosome fusion after 8 million years (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101418 - Hybridization-facilitated genome merger and repeated chromosome fusion after 8 million years (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101422 - Post-polyploid diploidization and diversification through dysploid changes (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101422 - Post-polyploid diploidization and diversification through dysploid changes (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101423 - Brassicales: an update on chromosomal evolution and ancient polyploidy (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101423 - Brassicales: an update on chromosomal evolution and ancient polyploidy (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101424 - Phylogeny and systematics of the tribe Thlaspideae (Brassicaceae) and the recognition of two new genera (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101424 - Phylogeny and systematics of the tribe Thlaspideae (Brassicaceae) and the recognition of two new genera (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00108135 - Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00108135 - Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00108137 - The large genome size variation in the Hesperis clade was shaped by the prevalent proliferation of DNA repeats and rarer genome downsizing (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00108137 - The large genome size variation in the Hesperis clade was shaped by the prevalent proliferation of DNA repeats and rarer genome downsizing (2019)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/12:00377728 - Stretching the Rules: Monocentric Chromosomes with Multiple Centromere Domains (2012)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/12:00381546 - Selfish supernumerary chromosome reveals its origin as a mosaic of host genome and organellar sequences (2012)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/12:00391039 - Next generation sequencing analysis reveals a relationship between rDNA unit diversity and locus number in Nicotiana diploids (2012)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/13:00392197 - The holocentric species Luzula elegans shows interplay between centromere and large-scale genome organization (2013)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/13:00392350 - RepeatExplorer: a Galaxy-based web server for genome-wide characterization of eukaryotic repetitive elements from next-generation sequence reads (2013)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/13:00394815 - Diploidization and genome size change in allopolyploids is associated with differential dynamics of low- and high-copy sequences (2013)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/13:00395041 - High-copy sequences reveal distinct evolution of the rye B chromosome (2013)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/14:00430448 - Genome-Wide Analysis of Repeat Diversity across the Family Musaceae (2014)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/14:00435933 - Differential amplification of satellite PaB6 in chromosomally hypervariable Prospero autumnale complex (Hyacinthaceae) (2014)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00440518 - Genes on B chromosomes: Old questions revisited with new tools (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00440552 - Genomic repeat abundances contain phylogenetic signal (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00447243 - Chromatin organization and cytological features of carnivorous Genlisea species with large genome size differences (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00449481 - Analysis of the giant genomes of Fritillaria (Liliaceae) indicates that a lack of DNA removal characterizes extreme expansions in genome size (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00450261 - Comparative Genome Analysis Reveals Divergent Genome Size Evolution in a Carnivorous Plant Genus (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00450286 - Holocentromeres in Rhynchospora are associated with genome-wide centromere-specific repeat arrays interspersed among euchromatin (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00454545 - In Depth Characterization of Repetitive DNA in 23 Plant Genomes Reveals Sources of Genome Size Variation in the Legume Tribe Fabeae (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/15:00454696 - Centromere and telomere sequence alterations reflect the rapid genome evolution within the carnivorous plant genus Genlisea (2015)
Výsledek druhu O RIV/60077344:_____/15:00456622 - Employing next generation sequencing to explore the repeat landscape of the plant genome (2015)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/16:00460268 - Repeat Composition of CenH3-chromatin and H3K9me2-marked heterochromatin in Sugar Beet (Beta vulgaris) (2016)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/16:00460269 - Plantago lagopus B Chromosome Is Enriched in 5S rDNA-Derived Satellite DNA (2016)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/17:00464891 - Centromeric and non-centromeric satellite DNA organisation differs in holocentric Rhynchospora species (2017)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/17:00479687 - TAREAN: a computational tool for identification and characterization of satellite DNA from unassembled short reads (2017)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/17:00480444 - Karyotypes and Distribution of Tandem Repeat Sequences in Brassica nigra Determined by Fluorescence in situ Hybridization (2017)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/18:00495072 - Satellite DNA in Vicia faba is characterized by remarkable diversity in its sequence composition, association with centromeres, and replication timing (2018)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/18:00496111 - Dating the Species Network: Allopolyploidy and Repetitive DNA Evolution in American Daisies (Melampodium sect. Melampodium, Asteraceae) (2018)
Výsledek druhu J RIV/60077344:_____/19:00509278 - Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda (2019)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/12:00381546 - Selfish supernumerary chromosome reveals its origin as a mosaic of host genome and organellar sequences (2012)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/13:00399936 - Syntenic Relationships between the U and M Genomes of Aegilops, Wheat and the Model Species Brachypodium and Rice as Revealed by COS Markers (2013)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/13:00421945 - Overexpressed TPX2 causes ectopic formation of microtubular arrays in the nuclei of acentrosomal plant cells (2013)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/13:00423097 - Reticulate Evolution of the Rye Genome (2013)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00429328 - Flow cytometric chromosome sorting from diploid progenitors of bread wheat, T. urartu, Ae. speltoides and Ae. tauschii (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00429596 - SNP Discovery for mapping alien introgressions in wheat (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00429975 - Advances in plant chromosome genomics (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00430448 - Genome-Wide Analysis of Repeat Diversity across the Family Musaceae (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00432721 - A chromosomal genomics approach to assess and validate the desi and kabuli draft chickpea genome assemblies (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00432722 - Next-Generation Survey Sequencing and the Molecular Organization of Wheat Chromosome 6B (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00433366 - A chromosome-based draft sequence of the hexaploid bread wheat (Triticum aestivum) genome (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00433557 - Common Wheat Chromosome 5B Composition Analysis Using Low-Coverage 454 Sequencing (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00433901 - Proteomic analysis of barley cell nuclei purified by flow sorting (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00433903 - Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B (2014)
Výsledek druhu C RIV/61389030:_____/14:00436386 - Flow Cytometry in Plant Research: A Success Story (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00436672 - The X Chromosome Is Necessary for Somatic Development in the Dioecious Silene latifolia: Cytogenetic and Molecular Evidence and Sequencing of a Haploid Genome (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00440405 - Expression response of duplicated metallothionein 3 gene to copper stress in Silene vulgaris ecotypes (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00441331 - Extensive Pericentric Rearrangements in the Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Genotype "Chinese Spring" Revealed from Chromosome Shotgun Sequence Data (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00441332 - Next-generation sequencing of flow-sorted wheat chromosome 5D reveals lineage-specific translocations and widespread gene duplications (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00441754 - Major haplotype divergence including multiple germin-like protein genes, at the wheat Sr2 adult plant stem rust resistance locus (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/14:00455510 - Characterization of the HMA7 gene and transcriptomic analysis of candidate genes for copper tolerance in two Silene vulgaris ecotypes (2014)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00446262 - LTR retrotransposon dynamics in the evolution of the olive (Olea europaea) genome (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00446325 - Fully automated pipeline for detection of sex linked genes using RNA-Seq data (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00446524 - New insights into the wheat chromosome 4D structure and virtual gene order, revealed by survey pyrosequencing (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00446962 - The physical map of wheat chromosome 5DS revealed gene duplications and small rearrangements (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00447026 - Molecular organization and comparative analysis of chromosome 5B of the wild wheat ancestor Triticum dicoccoides (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00447295 - Sequencing chromosome 5D of Aegilops tauschii and comparison with its allopolyploid descendant bread wheat (Triticum aestivum) (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00447326 - A high-resolution physical map integrating an anchored chromosome with the BAC physical maps of wheat chromosome 6B (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00450286 - Holocentromeres in Rhynchospora are associated with genome-wide centromere-specific repeat arrays interspersed among euchromatin (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00451416 - Impact of repetitive DNA on sex chromosome evolution in plants (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00454545 - In Depth Characterization of Repetitive DNA in 23 Plant Genomes Reveals Sources of Genome Size Variation in the Legume Tribe Fabeae (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00454969 - Multiple displacement amplification of the DNA from single flow?sorted plant chromosome (2015)
Výsledek druhu C RIV/61389030:_____/15:00454971 - Genomics of Wild Relatives and Alien Introgressions (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00455423 - Physical Mapping of Bread Wheat Chromosome 5A: An Integrated Approach (2015)
Výsledek druhu B RIV/61389030:_____/15:00455788 - Alien Introgression in Wheat (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/15:00456181 - Exploring the tertiary gene pool of bread wheat: sequence assembly and analysis of chromosome 5M(g) of Aegilops geniculata (2015)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/16:00461519 - The utility of flow sorting to identify chromosomes carrying a single copy transgene in wheat (2016)
Výsledek druhu C RIV/61389030:_____/16:00464539 - Chromosomal Allocation of DNA Sequences in Wheat Using Flow-Sorted Chromosomes (2016)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/16:00465513 - Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing (2016)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/16:00471226 - Chromosome-specific sequencing reveals an extensive dispensable genome component in wheat (2016)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00473677 - Rye B chromosomes encode a functional Argonaute-like protein with in vitro slicer activities similar to its A chromosome paralog (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00475905 - Satellite DNA and Transposable Elements in Seabuckthorn (Hippophae rhamnoides), a Dioecious Plant with Small Y and Large X Chromosomes (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00476520 - An advanced reference genome of Trifolium subterraneum L. reveals genes related to agronomic performance (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00478866 - Heritable heading time variation in wheat lines with the same number of Ppd-B1 gene copies (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00481223 - Sequencing flow-sorted short arm of Haynaldia villosa chromosome 4V provides insights into its molecular structure and virtual gene order (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00482959 - Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00488796 - Features of the organization of bread wheat chromosome 5BS based on physical mapping (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00489461 - Rht18 Semidwarfism in Wheat Is Due to Increased GA 2-oxidaseA9 Expression and Reduced GA Content (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00492763 - Large-Scale Structural Variation Detection in Subterranean Clover Subtypes Using Optical Mapping (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00493453 - Integration of Genetic and Cytogenetic Maps and Identification of Sex Chromosome in Garden Asparagus (Asparagus officinalis L.) (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00494250 - Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00495252 - Transcriptome reprogramming due to the introduction of a barley telosome into bread wheat affects more barley genes than wheat (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00497342 - Chromosome-based survey sequencing reveals the genome organization of wild wheat progenitor Triticum dicoccoides (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00497699 - The Aquilegia genome provides insight into adaptive radiation and reveals an extraordinarily polymorphic chromosome with a unique history (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00502558 - Pm21 from Haynaldia villosa Encodes a CC-NBS-LRR Protein Conferring Powdery Mildew Resistance in Wheat (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/19:00509278 - Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda (2019)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/20:00523511 - The improved assembly of 7DL chromosome provides insight into the structure and evolution of bread wheat (2020)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/12:00379844 - Plant rDNA database: ribosomal DNA loci information goes online (2012)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/12:00383613 - The key role of repeated DNAs in sex chromosome evolution in two fish species with ZW sex chromosome system (2012)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/12:00384641 - NBS1 plays a synergistic role with telomerase in the maintenance of telomeres in Arabidopsis thaliana (2012)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/12:00384891 - Comparative analysis of a plant pseudoautosomal region (PAR) in Silene latifolia with the corresponding S. vulgaris autosome (2012)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/12:00389622 - Expression of 5 S rRNA genes linked to 35 S rDNA in plants, their epigenetic modification and regulatory element divergence (2012)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/12:00391039 - Next generation sequencing analysis reveals a relationship between rDNA unit diversity and locus number in Nicotiana diploids (2012)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00392612 - Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00394804 - Dancing together and separate again: gymnosperms exhibit frequent changes of fundamental 5S and 35S rRNA gene (rDNA) organisation (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00394815 - Diploidization and genome size change in allopolyploids is associated with differential dynamics of low- and high-copy sequences (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00394816 - Transitive RNA silencing signals induce cytosine methylation of a transgenic but not an endogenous target (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00422259 - Evolution of sex determination systems with heterogametic males and females in Silene (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00422432 - Epigenetic switches of tobacco transgenes associate with transient redistribution of histone marks in callus culture (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00440145 - Analysis of plastid and mitochondrial DNA insertions in the nucleus (NUPTs and NUMTs) of six plant species: size, relative age and chromosomal localization (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00440410 - Patterns of molecular evolution in dioecious and non-dioecious Silene (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00424729 - Strong Accumulation of Chloroplast DNA in the Y Chromosomes of Rumex acetosa and Silene latifolia (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00428114 - How to interpret Methylation Sensitive Amplified Polymorphism (MSAP) profiles? (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00431583 - When fathers are instant losers: homogenization of rDNA loci in recently formed Cardamine X schulzii trigenomic allopolyploid (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00435933 - Differential amplification of satellite PaB6 in chromosomally hypervariable Prospero autumnale complex (Hyacinthaceae) (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00436672 - The X Chromosome Is Necessary for Somatic Development in the Dioecious Silene latifolia: Cytogenetic and Molecular Evidence and Sequencing of a Haploid Genome (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00440147 - The Evolutionary Fate of the Horizontally Transferred Agrobacterial Mikimopine Synthase Gene in the Genera Nicotiana and Linaria (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00440398 - Characterization of the HMA7 gene and transcriptomic analysis of candidate genes for copper tolerance in two Silene vulgaris ecotypes (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00440405 - Expression response of duplicated metallothionein 3 gene to copper stress in Silene vulgaris ecotypes (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00446225 - The genomics of plant sex chromosomes (2015)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00446325 - Fully automated pipeline for detection of sex linked genes using RNA-Seq data (2015)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00454696 - Centromere and telomere sequence alterations reflect the rapid genome evolution within the carnivorous plant genus Genlisea (2015)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00456703 - Angiosperms Are Unique among Land Plant Lineages in the Occurrence of Key Genes in the RNA-Directed DNA Methylation (RdDM) Pathway (2015)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00506513 - Impact of repetitive DNA on sex chromosome evolution in plants (2015)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/16:00457675 - Interpopulation hybridization generates meiotically stable rDNA epigenetic variants in allotetraploid Tragopogon mirus (2016)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/16:00459165 - The origin of exon 3 skipping of paternal GLOBOSA pre-mRNA in some Nicotiana tabacum lines correlates with a point mutation of the very last nucleotide of the exon (2016)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/16:00470767 - Astonishing 35S rDNA diversity in the gymnosperm species Cycas revoluta Thunb (2016)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/16:00471955 - Conserved Organisation of 45S rDNA Sites and rDNA Gene Copy Number among Major Clades of Early Land Plants (2016)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/17:00475270 - Higher-order organisation of extremely amplified, potentially functional and massively methylated 5S rDNA in European pikes (Esox sp.) (2017)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/17:00485518 - Epigenetic control of reproductive development (2017)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/17:00485763 - Satellite DNA and Transposable Elements in Seabuckthorn (Hippophae rhamnoides), a Dioecious Plant with Small Y and Large X Chromosomes (2017)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/17:00507078 - Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction (2017)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/18:00492528 - Consequences of Lamin B1 and Lamin B Receptor Downregulation in Senescence (2018)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/18:00494402 - Application of magnetic polymethacrylate-based microspheres for the isolation of DNA from raw vegetables and processed foods of plant origin (2018)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/18:00495174 - Organization and evolution of two repetitive sequences, 18-24J and 12-13P, in the genome of Chenopodium (Amaranthaceae) (2018)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/18:00495519 - DNA methylation and genetic degeneration of the Y chromosome in the dioecious plant Silene Iatifolia (2018)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/18:00502514 - Gibberellin A(3) as an epigenetic determinant of global DNA hypo-methylation in tobacco (2018)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/19:00502847 - Parental transposable element loads influence their dynamics in young Nicotiana hybrids and allotetraploids (2019)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky Cílem projektu bylo studium struktury a dynamiky genomu, úlohy repetitivních sekvencí, vzniku a evoluce pohlavních chromosomů, polyploidie a hybridizace u rostlin a jejich významu pro evoluci a pochopení epigenetických procesů určujících rostlinný fenotyp. Výsledkem projektu je 119 publikací ve impaktovaných časopisech, včetně publikace genomové sekvence pšenice.
Vyhledávání ...