Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGAP501/11/0289 - Ztráta specifických repetic DNA v důsledku dysfunkce CAF1 u rostlin (2011-2015, GA0/GA)

Identifikační kód	GAP501/11/0289
Důvěrnost údajů	S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce	Ztráta specifických repetic DNA v důsledku dysfunkce CAF1 u rostlin
Název projektu anglicky	Loss of specific DNA repeats in response to dysfunction of CAF1 in plants
Poskytovatel	GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Program	GA - Standardní projekty  (1993 - 2050)
Kategorie VaV	ZV - Základní výzkum
Hlavní obor - skupina	E - Biovědy
Hlavní obor	EB - Genetika a molekulární biologie
Vedlejší obor	-
Další vedlejší obor	-
Zahájení řešení	01.01.2011
Ukončení řešení	31.12.2015
Datum posledního uvolnění účelové podpory	20.04.2015
Číslo smlouvy	P501-11-0289
Poslední stav řešení	U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
Kčtis. Kč ** Finance projektu 2011 2012 2013 2014 2015 celkem Výše podpory z národních zdrojů 1 666 000,001666 1 755 000,001755 1 755 000,001755 1 755 000,001755 1 755 000,001755 8 686 000,008686 Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Celkové uznané náklady 1 666 000,001666 1 755 000,001755 1 755 000,001755 1 755 000,001755 1 755 000,001755 8 686 000,008686 Typ čerpané čerpané čerpané čerpané čerpané ** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa *** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů » Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů 2011 2012 2013 2014 2015 celkem Finance 1 666 000,001666 1 755 000,001755 1 755 000,001755 1 755 000,001755 1 755 000,001755 8 686 000,008686
Druh soutěže	VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích	SGA02011GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA)
Cíle řešení v původním jazyce	Chromatin assembly factor 1 (CAF1) je třísložkový histonový chaperon, který ukládá histony H3/H4 na replikující se DNA. Mutanti Arabidopsis v CAF1 vykazují abnormální morfologii, změny v umlčování genů a zvýšenou homologní rekombinaci. Naše pilotní studie ukázala, že dysfunkce CAFI má za následek zkracování telomer a značnou ztrátu 45S rDNA, aniž by byly ovlivněny ostatní DNA repetice v genomu Arabidopsis. Pomocí genetických a biochemických přístupů budeme testovat naši hypotézu, že pozorovaná ztráta telomer a 45S rDNA je způsobena neúplnou replikací (v důsledku zastavující se replikace v těchto lokusech) a následných opravných procesů. Bude rovněž zkoumána účast jiných mechanismů (např. nedostatečnost telomerázy, kolize transkripce a replikace). Příčinná role mutací v CAF1 bude testována zpětným křížením a komplementací s cílem indukovat možnou reverzi genomických změn. Cílem projektu je tedy objasnit vzájemný vliv genetických a epigenetických procesů (sestavování chromatinu, replikace, rekombinace a oprav DNA, udržování telomer) na stabilitu genomu.
Cíle řešení v anglickém jazyce	Chromatin assembly factor 1 (CAF1) is a three-subunit histone chaperone depositing histones H3/H4 onto replicating DNA. Arabidopsis CAF1 mutants show abnormal morphology, changes in gene silencing and increased homol. recombination. Our pilot study shows that dysfunction of CAF1 results in telomere shortening and severe loss of 45S rDNA, without affecting the other Arabidopsis DNA repeats. Using genetic and biochemical approaches, we will test our hypothesis that the observed loss of telomeres and 45S rDNA results from incomplete replication (due to replication stalling in these loci) and subsequent repair events. Involvement of other mechanisms (e.g., telomerase insufficiency, transcription/replication collisions) will also be considered. Causative role of CAF1 mutations will be tested by backcrossing and complementation experiments to induce a possible reversal of the genomic changes. The project thus aims to elucidate interplay between genetic and epigenetic processes (chromatin assembly, DNA replication, repair and recombination, telomere maintenance) in genome stability control.
Klíčová slova v anglickém jazyce	FAS mutants Arabidopsis telomeres 45SrDNA
Kontrolní číslo stavu projektu v letech	2011: 176322478 2012: 188226513 2013: 189377587 2014: 183548056 2015: 187096444 2016: 190679089 ( v1.0 )
Datum dodání posledního záznamu o projektu	25.09.2017
Systémové označení dodávky dat	CEP16-GA0-GA-U/01:1

Účastníci projektu

Počet příjemců	1
Počet dalších účastníků projektu	0

Příjemce	Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Řešitel	prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 8202575)

Kčtis. Kč **

Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady	2011	2012	2013	2014	2015
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta	1 666 000,001666	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	1 666 000,001666	1 755 000,001755	1 755 000,001755	1 755 000,001755	1 755 000,001755

Výše podpory z národních zdrojů	2011	2012	2013	2014	2015
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta	1 666 000,001666	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	1 666 000,001666	1 755 000,001755	1 755 000,001755	1 755 000,001755	1 755 000,001755

Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů	2011	2012	2013	2014	2015
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce	2011	2012	2013	2014	2015
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka během jednotlivých let	2011	2012	2013	2014	2015
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut	1 666 000,001666	1 755 000,001755	1 755 000,001755	1 755 000,001755	1 755 000,001755

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem	14
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/11:00050252 - Hypomethylating drugs efficiently decrease cytosine methylationin telomeric DNA and activate telomerase without affectingtelomere lengths in tobacco cells (2011)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/11:00050252 - Hypomethylating drugs efficiently decrease cytosine methylationin telomeric DNA and activate telomerase without affectingtelomere lengths in tobacco cells (2011)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/13:00066297 - Subnuclear partitioning of rRNA genes between the nucleolus and nucleoplasm reflects alternative epiallelic states (2013)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/13:00066297 - Subnuclear partitioning of rRNA genes between the nucleolus and nucleoplasm reflects alternative epiallelic states (2013)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/13:00066822 - A telomerase-independent component of telomere loss in chromatin assembly factor 1 mutants of Arabidopsis thaliana (2013)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/13:00066822 - A telomerase-independent component of telomere loss in chromatin assembly factor 1 mutants of Arabidopsis thaliana (2013)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/14:00074401 - Epigenetic Regulation of Telomere Maintenance (2014)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/14:00074401 - Epigenetic Regulation of Telomere Maintenance (2014)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/15:00080676 - Homology-dependent repair is involved in 45S rDNA loss in plant CAF-1 mutants (2015)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/15:00080676 - Homology-dependent repair is involved in 45S rDNA loss in plant CAF-1 mutants (2015)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/15:00080972 - Chromatin dynamics of plant telomeres and ribosomal genes (2015)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/15:00080972 - Chromatin dynamics of plant telomeres and ribosomal genes (2015)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/16:00088685 - Phenotypic reversion in fas mutants of Arabidopsis thaliana by reintroduction of FAS genes: variable recovery of telomeres with major spatial rearrangements and transcriptional reprogramming of 45S rDNA genes (2016)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14740/16:00088685 - Phenotypic reversion in fas mutants of Arabidopsis thaliana by reintroduction of FAS genes: variable recovery of telomeres with major spatial rearrangements and transcriptional reprogramming of 45S rDNA genes (2016)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků	V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky	Řešení projektu přineslo detailní popis nového typu genetické nestability způsobené vyřazením fas genů. Byly zjištěny souvislosti mezi danými mutacemi a progresivní ztrátou telomer a 45S rDNA repetic. Mechanizmem způsobujícím ztráty je nehomologní rekombinace. Výstupem projektu je 6 publikací v prestižních časopisech. Projekt je hodnocen jako vynikající.