Identifikační kód |
GAP501/10/1014 |
Důvěrnost údajů |
S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných
informačních systémů včetně mezinárodních |
Název projektu v původním jazyce |
Evoluce genomu alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) rozdílného fylogenetického stáří |
Název projektu anglicky |
Genome evolution in Cardamine allopolyploids of contrasting phylogenetic age |
Poskytovatel |
GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
Program |
GA - Standardní projekty (1993 - 2050) |
Kategorie VaV |
ZV - Základní výzkum |
Hlavní obor - skupina |
E - Biovědy |
Hlavní obor |
EB - Genetika a molekulární biologie |
Vedlejší obor |
EF - Botanika |
Další vedlejší obor |
- |
Zahájení řešení |
01.01.2010 |
Ukončení řešení |
15.04.2014 |
Datum posledního uvolnění účelové podpory |
01.04.2014 |
Číslo smlouvy |
P501-10-1014 |
Poslední stav řešení |
U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR) |
Finance projektu | 2010 | 2011 | 2012 | 2013 | 2014 | celkem |
---|
Výše podpory z národních zdrojů | 2 319 000,002319 | 2 639 000,002639 | 1 785 000,001785 | 0,000 | 0,000 | 6 743 000,006743 | Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | Celkové uznané náklady | 2 319 000,002319 | 2 639 000,002639 | 1 785 000,001785 | 0,000 | 0,000 | 6 743 000,006743 | Typ | čerpané | čerpané | čerpané | - | - | |
** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa *** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020
|
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »
Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů | 2010 | 2011 | 2012 | 2013 | 2014 | celkem |
---|
Finance | 2 319 000,002319 | 2 639 000,002639 | 1 785 000,001785 | 0,000 | 0,000 | 6 743 000,006743 |
|
Druh soutěže |
VS - Veřejná soutěž |
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích |
SGA02010GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA) |
Cíle řešení v původním jazyce |
Polyploidie hraje významnou roli při speciaci semenných rostlin. Nicméně překvapivě málo je známo o stabilitě chromosomů v prvních generacích po vzniku alopolyploidů a u evolučně mladých polyploidů. Poprvé bude použita technika kombinované GISH a SMC (genomická in situ hybridizace a srovnávací malování chromosomů) u hybridních a alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) k analýze intergenomických chromosomových interakcí. GISH identifikuje rodičovské chromosomové sady a intergenomické translokace, zatímco SMC odhalí inter- a intrachromosomové přestavby. Stabilita chromosomů bude analyzována u nedávno (ca. 100 let) vzniklého triploidního hybrida C. ´ insueta (2n=24) a autoalohexaploida C. schulzii (2n=48), a u evolučně staršího druhu C. flexuosa (2n=32). U tří analyzovaných alopolyploidních taxonů budou etablovány syntetické linie a chromosomová stabilita monitorována v posloupných generacích. Příčiny karyologické variability budou studovány na základě analýzy jaderných a chloroplastových markerů. |
Cíle řešení v anglickém jazyce |
Polyploidy is playing a crucial role in speciation of spermatophytes. Nevertheless, surprisingly little is known about the chromosome stability in first generations following the polyploid origin and in recent polyploids. For the first time, the combined GISH/CCP technique (Genomic In Situ Hybridization/Comparative Chromosome Painting) will be applied to analyze inter-genomic chromosomal interactions in Cardamine hybrids and allopolyploids. GISH will identify parental chromosome complements and inter-genomic translocations, whereas CCP will pinpoint inter- and intra-chromosome rearrangements. The chromosome stability will be analyzed in the recent hybrid Cardamine ´ insueta (2n=24) and its autoallohexaploid derivative C. schulzii (2n=48) (both c. 100 years old), as compared to an old allotetraploid species C. flexuosa (2n=32). For the three taxa, synthetic lines will be established and the chromosome stability monitored in successive generations. Karyological variation will be related to phylogenetic relationships inferred from the analysis of nuclear and chloroplast markers. |
Klíčová slova v anglickém jazyce |
polyploidy inter-species hybridization chromosome rearrangements genomic in situ hybridization comparative chromosome painting cytogenetics molecular phylogenetics Brassicaceae |
Kontrolní číslo stavu projektu v letech |
2010: 158606435 2011: 176322457 2012: 188226367 2013: 189379113 2015: 190679377 |
Datum dodání posledního záznamu o projektu |
30.09.2017 |
Systémové označení dodávky dat |
CEP15-GA0-GA-U/01:2 |