Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Centrální evidence projektů

Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGAP301/11/2076 - Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73 (2011-2015, GA0/GA)

Identifikační kód GAP301/11/2076
Důvěrnost údajů S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73
Název projektu anglicky DNA binding, stress-induced expression and transactivation activity of p73 protein isoforms
Poskytovatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Program GA - Standardní projekty  (1993 - 2050)
Kategorie VaV ZV - Základní výzkum
Hlavní obor - skupina E - Biovědy
Hlavní obor EB - Genetika a molekulární biologie
Vedlejší obor FD - Onkologie a hematologie
Další vedlejší obor CE - Biochemie
Zahájení řešení 01.01.2011
Ukončení řešení 13.04.2015
Datum posledního uvolnění účelové podpory 01.04.2015
Číslo smlouvy P301-11-2076
Poslední stav řešení U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
tis. Kč **
Finance projektu
20112012201320142015celkem
Výše podpory z národních zdrojů1 985 000,0019851 983 000,0019831 985 000,0019850,0000,0005 953 000,005953
Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů ***0,0000,0000,0000,0000,0000,000
Celkové uznané náklady1 985 000,0019851 983 000,0019831 985 000,0019850,0000,0005 953 000,005953
Typčerpanéčerpanéčerpané--

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020

Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »

Druh soutěže VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích SGA02011GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA)
Cíle řešení v původním jazyce Protein p73 patří mezi transkripční faktory rodiny p53, vykazuje vysokou homologii s proteinem p53 a je schopen aktivovat celou řadu genů, které se podílejí na regulaci buněčného cyklu a apoptózy. Podobně jako u proteinu p53 bylo identifikováno několik izoforem proteinu p73, které se liší strukturou, ale dosud chybí komplexnější data o jejich DNA-vazebných vlastnostech, vzájemné interakci a kooperaci, které mohou mít vliv na genovou expresi. Tento projekt je zaměřen (i) na in vitro studie rozpoznání různých DNA substrátů (nadšroubovicová, lineární, chemicky poškozená DNA) vybranými izoformami proteinů p73 a p53, a (ii) na DNA interakce a transaktivační aktivity exogenních a endogenních izoforem p73 a p53 ve vybraných buněčných liniích (s definovaným statutem p53) vystavených různým stresovým podmínkám. V těchto experimentech budou využity primárně metody imunoprecipitace p73 nebo p53-DNA komplexů, EMSA, prodlužování primerů pomocí DNA-polymeráz a PCR metody, p73/p53 promotor-specifické reportérové fůze a western blot analýzy exprese p73/p53 izoforem.
Cíle řešení v anglickém jazyce Protein p73, a member of p53 family of transcription factors, shares remarkable homology with p53 protein and is able to transactivate many of p53-downstream genes involved in regulation of cell cycle and apoptosis. Just like by p53, several p73 isoforms were identified, which differ in their structure, however little is known about their DNA-binding properties, mutual interplay and cooperation, which might influence gene expression. This project is focused (ii) on in vitro studies of recognition of various DNA substrates (supercoiled, linear, chemically modified DNA) by selected p73 and p53 isoforms and (ii) on studies of DNA-binding and transactivation activities of both exogenous and endogenous p73 and p53 isoforms in different cell lines (with defined p53 status) exposed to different stress conditions. These investigations will be performed primarily using immunoprecipitation of the p73- or p53-DNA complexes and EMSA techniques, primer extension and PCR based methods, p53/p73 promoter-specific reporter assays and western blot analysis of p53/p73 isoform specific expression.
Klíčová slova v anglickém jazyce protein p73 isoforms tumor suppression DNA-protein interactions stress gene expression transcription
Kontrolní číslo stavu projektu v letech 2011: 176320269
2012: 188220948
2013: 189376135
2014: 183547315
2015: 187092523
2016: 190678970 ( v1.0 )
Datum dodání posledního záznamu o projektu 25.09.2017
Systémové označení dodávky dat CEP16-GA0-GA-U/01:1

Účastníci projektu

Počet příjemců 2
Počet dalších účastníků projektu 0
Příjemce Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
ŘešitelMgr. Hana Pivoňková, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 7506481)
Příjemce Masarykův onkologický ústav
ŘešitelMgr. Jitka Holčáková, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 4001818)

tis. Kč **
Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady20112012201320142015
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.1 620 000,0016201 619 000,0016191 620 000,0016200,0000,000
Masarykův onkologický ústav365 000,00365364 000,00364365 000,003650,0000,000
Výše podpory z národních zdrojů20112012201320142015
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.1 620 000,0016201 619 000,0016191 620 000,0016200,0000,000
Masarykův onkologický ústav365 000,00365364 000,00364365 000,003650,0000,000
Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů20112012201320142015
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,000
Masarykův onkologický ústav0,0000,0000,0000,0000,000
Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce20112012201320142015
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,0000,0000,000
Masarykův onkologický ústav0,0000,0000,0000,0000,000

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem 8
Výsledek druhu J RIV/00209805:_____/13:#0000406 - Intracellular distribution of the ?Np73 protein isoform in medulloblastoma cells: a study with newly generated rabbit polyclonal antibodies (2013)
Výsledek druhu J RIV/00209805:_____/13:#0000406 - Intracellular distribution of the ?Np73 protein isoform in medulloblastoma cells: a study with newly generated rabbit polyclonal antibodies (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00392682 - Redox state of p63 and p73 core domains regulates sequence-specific DNA binding (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00398521 - Vinylsulfonamide and Acrylamide Modification of DNA for Cross-linking with Proteins (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/13:00422257 - Preferential binding of p53 tumor suppressor to p21 promoter sites that contain inverted repeats capable of forming cruciform structure (2013)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/14:00435469 - Electrochemical detection of DNA binding by tumor suppressor p53 protein using osmium-labeled oligonucleotide probes and catalytic hydrogen evolution at the mercury electrode (2014)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00446270 - Biophysical and electrochemical studies of protein-nucleic acid interactions (2015)
Výsledek druhu J RIV/68081707:_____/15:00446345 - Differential Salt-Induced Dissociation of the p53 Protein Complexes with Circular and Linear Plasmid DNA Substrates Suggest Involvement of a Sliding Mechanism (2015)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky Odložení závěrečné zprávy přispělo k celkové prezentaci obdržených výsledků a vedlo k uveřejnění 6 prací s IF a jedna další byla přijata do tisku. Řešitelé řádně zdůvodnili změny v plánu prací, které v konečném důsledku vedly ke kvalitnějším výstupům a vytvoření platformy pro další zkoumání Závěrečná zpráva mohla být čtivější a strukturovaná vzhledem k cílům projektu a publikovaným pracím.
Vyhledávání ...