| Identifikační kód |
GA521/06/1723 |
| Důvěrnost údajů |
S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných
informačních systémů včetně mezinárodních |
| Název projektu v původním jazyce |
Konstrukce BAC knihovny a fyzické mapování chromozómu 3D pšenice |
| Název projektu anglicky |
Construction of BAC library and physical mapping of the wheat chromosome 3D |
| Poskytovatel |
GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Program |
GA - Standardní projekty (1993 - 2050) |
| Kategorie VaV |
ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor - skupina |
G - Zemědělství |
| Hlavní obor |
GE - Šlechtění rostlin |
| Vedlejší obor |
EB - Genetika a molekulární biologie |
| Další vedlejší obor |
EI - Biotechnologie a bionika |
| Zahájení řešení |
01.01.2006 |
| Ukončení řešení |
31.12.2008 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory |
25.04.2008 |
| Číslo smlouvy |
521/06/1723 |
| Poslední stav řešení |
U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR) |
| Finance projektu | 2006 | 2007 | 2008 | celkem |
|---|
| Výše podpory z národních zdrojů | 1 481 000,001481 | 966 000,00966 | 984 000,00984 | 3 431 000,003431 | | Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | | Celkové uznané náklady | 1 481 000,001481 | 966 000,00966 | 984 000,00984 | 3 431 000,003431 | | Typ | čerpané | čerpané | čerpané | |
** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020 |
|
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »
| Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů | 2006 | 2007 | 2008 | celkem |
|---|
| Finance | 1 481 000,001481 | 966 000,00966 | 984 000,00984 | 3 431 000,003431 |
|
| Druh soutěže |
VS - Veřejná soutěž |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích |
SGA02006GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA) |
| Cíle řešení v původním jazyce |
Značná velikost a polyploidní původ jaderného genomu pšenice seté komplikují jeho sekvenování, analýzu a klonování genů. Tyto postupy mohou být zjednodušeny rozdělením genomu na malé definované části. Navrhujeme připravit dvě subgenomové knihovny DNA klonované ve vektoru BAC, specifické pro krátké a dlouhé rameno chromozómu 3D. Jejich konstrukcí bude dokončena příprava genomových zdrojů pro homeologní skupinu 3, která byla mezinárodním konsorciem zvolena pro pilotní fázi sekvenování genomu pšenice. BACknihovny specifické pro chromozóm 3D použijeme pro odvození cytogenetické mapy a ve spolupráci s J. Dvořákem (UC, Davis) pro přípravu fyzické mapy chromozómu. Použijeme je rovněž pro izolaci potenciálně kódujících sekvencí DNA, identifikaci genově bohatých oblastí a pro hromadné mapování exprimovaných sekvencí DNA na chromozómu 3D pomocí DNA čipu (ve spolupráci s T. Close, UC, Davis). Řešení projektu otevře nové možnosti pro komparativní analýzu evoluce genomu pšenice a studium interakce jejích |
| Cíle řešení v anglickém jazyce |
The large size and polyploid nature of the nuclear genome of bread wheat pose a great challenge for the understanding of complete genome information, genome sequencing and gene discovery. This task could be simplified by fractionating the genome into small and defined parts. Here we propose to create two subgenomic BAC libraries specific for short and long arm of wheat chromosome 3D. Their creation will mark the completion of BAC resources for homeologous group 3, which has been selected for the pilot phase of the wheat genome sequencing project. 3D-specifc BAC resources developed in this project will be used to develop a molecular cytogenetic map and, in collaboration with Prof. J. Dvořák (UC, Davis), a physical contig map of 3D. They will alsobe usedfor targeted isolation of low-copy (potentially coding) DNA sequences, discovery of gene-rich regions on 3D, and for high-throughput mapping of expressed sequences to chromosome 3D using wheat GeneChip (collaboration with Prof. T. Close, UC, |
| Klíčová slova v anglickém jazyce |
Cytogenetic map; Physical map; Coding sequences |
| Kontrolní číslo stavu projektu v letech |
2006: 33532606
2007: 2187465
2008: 167360751
2009: 68675381 |
| Datum dodání posledního záznamu o projektu |
22.10.2009 |
| Systémové označení dodávky dat |
CEP09-GA0-GA-U/02:2 |