Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGA203/09/0317 - Konstrukce nových funkčních nukleových kyselin pro aplikace v chemické biologii, katalýze a samoskladbě. (2009-2013, GA0/GA)

Identifikační kód	GA203/09/0317
Důvěrnost údajů	S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce	Konstrukce nových funkčních nukleových kyselin pro aplikace v chemické biologii, katalýze a samoskladbě.
Název projektu anglicky	Construction of novel functional nucleic acids for applications in chemical biology, catalysis and self assembly.
Poskytovatel	GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Program	GA - Standardní projekty  (1993 - 2050)
Kategorie VaV	ZV - Základní výzkum
Hlavní obor - skupina	C - Chemie
Hlavní obor	CC - Organická chemie
Vedlejší obor	CE - Biochemie
Další vedlejší obor	CA - Anorganická chemie
Zahájení řešení	01.01.2009
Ukončení řešení	31.12.2013
Datum posledního uvolnění účelové podpory	12.06.2013
Číslo smlouvy	203-09-0317
Poslední stav řešení	U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
Kčtis. Kč ** Finance projektu 2009 2010 2011 2012 2013 celkem Výše podpory z národních zdrojů 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 9 985 000,009985 Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Celkové uznané náklady 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 9 985 000,009985 Typ čerpané čerpané čerpané čerpané čerpané ** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa *** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů » Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů 2009 2010 2011 2012 2013 celkem Finance 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 1 997 000,001997 9 985 000,009985
Druh soutěže	VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích	SGA02009GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA)
Cíle řešení v původním jazyce	Projekt je zaměřen na vývoj nové efektivní metodiky konstrukce funkcionalizovaných DNA duplexů a oligonukleotidů ve dvou krocích. Prvním krokem bude přímá modifikace nukleosid trifosfátů pomocí cross-coupling reakcí ve vodě. Následovat bude enzymatická inkorporace modifikovaných nukleosid trifosfátů do DNA polymerasami (např. metodami primer extension nebo PCR). Bude rovněž rozvíjena alternativní metodika spočívající v připojení substituentu cross-coupling reakcemi halogenovaných oligonukleotidů. Oběmatypy metodik budeme konstruovat funkční nukleové kyseliny nesoucí různé typy funkčních skupin aplikovatelné např. v chemické biologii, samoskladbě, nanotechnologiích a katalýze.
Cíle řešení v anglickém jazyce	The aim of this project is the development of a novel efficient straight-forward methodology for construction of functionalized DNA duplexes and oligonucleotides in two steps. The first step will consist of direct modification of nucleoside triphosphatesby cross-coupling reactins in water. The modified dNTPs will be then used for enzymatic incroporation to DNA by polymerases (e.g. using primer extension or PCR). Alternative methodology of attachment of a substituent based on cross-coupling reactions ofhalogenated oligonucleotides will be also devepoled. Both these types of methodology will be used for construction of functional nucleic acids bearing diverse types of useful functional groups applicable in chemical biology, self assembly, nanotechnology and catalysis.
Klíčová slova v anglickém jazyce	nucleotides nucleoside triphosphates polymerases oligonucleotides DNA RNA
Kontrolní číslo stavu projektu v letech	2009: 68718567 2010: 158571136 2011: 176325786 2012: 188202226 2013: 189379386 2014: 184160737
Datum dodání posledního záznamu o projektu	01.07.2014
Systémové označení dodávky dat	CEP14-GA0-GA-U/01:1

Účastníci projektu

Počet příjemců	0
Počet dalších účastníků projektu	2

Další účastník projektu	Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Další účastník projektu	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Kčtis. Kč **

Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady	2009	2010	2011	2012	2013
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799

Výše podpory z národních zdrojů	2009	2010	2011	2012	2013
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799

Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů	2009	2010	2011	2012	2013
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce	2009	2010	2011	2012	2013
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka během jednotlivých let	2009	2010	2011	2012	2013
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198	1 198 000,001198
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799	799 000,00799

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem	24
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/09:00334373 - Cleavage of adenine-modified functionalized DNA by type II restriction endonucleases (2009)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/10:00342359 - Synthesis of nucleoside and nucleotide conjugates of bile acids, and polymerase construction of bile acid-functionalized DNA (2010)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/10:00342374 - Direct polymerase synthesis of reactive aldehyde-functionalized DNA and its conjugation and staining with hydrazines (2010)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/11:00360993 - Cleavage of Functionalized DNA Containing 5-Modified Pyrimidines by Type II Restriction Endonucleases (2011)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/11:00360994 - Synthesis of acetylene linked double-nucleobase nucleos(t)ide building blocks and polymerase construction of DNA containing cytosines in the major groove (2011)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/11:00360998 - Alkylsulfanylphenyl derivatives of cytosine and 7-deazaadenine nucleosides, nucleotides and nucleoside triphosphates. Synthesis, polymerase incorporation to DNA and electrochemical study (2011)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/11:00364215 - Transient and Switchable (Triethylsilyl)ethynyl Protection of DNA against Cleavage by Restriction Endonucleases (2011)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/11:00368112 - Nucleobase modification as redox DNA labelling for electrochemical detection (2011)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/12:00377716 - Synthesis of nucleoside mono- and triphosphates bearing oligopyridine ligands, their incorporation into DNA and complexation with transition metals (2012)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/12:00377722 - Synthesis and Photophysical Properties of Biaryl-Substituted Nucleos(t)ides. Polymerase Synthesis of DNA Probes Bearing Solvatochromic and pH Sensitive Dual Fluorescent and 19F NMR Labels (2012)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/12:00377777 - Synthesis of Aldehyde-Linked Nucleotides and DNA and Their Bioconjugations with Lysine and Peptides through Reductive Amination (2012)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/12:00377953 - Preparation of short cytosine-modified oligonucleotides by nicking enzyme amplification reaction (2012)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/12:00382144 - Labelling of nucleosides and oligonucleotides by solvatochromic 4-aminophthalimide fluorophore for studying DNA?protein interactions (2012)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/12:00382270 - GFP-like Fluorophores as DNA Labels for Studying DNA-Protein Interactions (2012)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/13:00391779 - Synthesis of nucleosides and dNTPs bearing oligopyridine ligands linked through an octadiyne tether, their incorporation into DNA and complexation with transition metal cations (2013)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/13:00393858 - Nucleobase protection strategy for gene cloning and expression (2013)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/13:00394750 - Scope and Limitations of the Nicking Enzyme Amplification Reaction for the Synthesis of Base-Modified Oligonucleotides and Primers for PCR (2013)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/13:00398521 - Vinylsulfonamide and Acrylamide Modification of DNA for Cross-linking with Proteins (2013)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/14:00429705 - Příprava DNA s modifikovanými bázemi enzymatickou inkorporací modifikovaných nukleosid-trifosfátů (2014)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/11:00360998 - Alkylsulfanylphenyl derivatives of cytosine and 7-deazaadenine nucleosides, nucleotides and nucleoside triphosphates. Synthesis, polymerase incorporation to DNA and electrochemical study (2011)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/11:00368112 - Nucleobase modification as redox DNA labelling for electrochemical detection (2011)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/12:00382144 - Labelling of nucleosides and oligonucleotides by solvatochromic 4-aminophthalimide fluorophore for studying DNA?protein interactions (2012)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/12:00382270 - GFP-like Fluorophores as DNA Labels for Studying DNA-Protein Interactions (2012)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/13:00398521 - Vinylsulfonamide and Acrylamide Modification of DNA for Cross-linking with Proteins (2013)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků	V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky	V průbehu řešení projektu byla vyvinuta originální metodika přípravy oligonukleotidů a DNA modifikovanými fluorescenčními značkami použitelnými pro studium interakcí s proteiny a se reaktivní skupinami pro kovalentní vazby na proteiny. Bylo publikováno ?