| Identifikační kód |
GA17-09644S |
| Důvěrnost údajů |
S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných
informačních systémů včetně mezinárodních |
| Název projektu v původním jazyce |
Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales |
| Název projektu anglicky |
Molecular nature of evolutionary telomere transitions in Asparagales plants |
| Poskytovatel |
GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Program |
GA - Standardní projekty (1993 - 2050) |
| Kategorie VaV |
ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor - skupina |
E - Biovědy |
| Hlavní obor |
EB - Genetika a molekulární biologie |
| Vedlejší obor |
- |
| Další vedlejší obor |
- |
| Zahájení řešení |
01.01.2017 |
| Ukončení řešení |
31.12.2019 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory |
26.04.2019 |
| Číslo smlouvy |
17-09644S |
| Poslední stav řešení |
U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR) |
| Finance projektu | 2017 | 2018 | 2019 | celkem |
|---|
| Výše podpory z národních zdrojů | 3 000 000,003000 | 3 000 000,003000 | 3 000 000,003000 | 9 000 000,009000 | | Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | | Ostatní veřejné zdroje financování | - | - | - | 1 203 000,001203 | | Celkové uznané náklady | 3 401 000,003401 | 3 401 000,003401 | 3 401 000,003401 | 10 203 000,0010203 | | Typ | čerpané | čerpané | čerpané | |
** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020 |
|
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »
| Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů | 2017 | 2018 | 2019 | celkem |
|---|
| Finance | 3 000 000,003000 | 3 000 000,003000 | 3 000 000,003000 | 9 000 000,009000 |
|
| Druh soutěže |
VS - Veřejná soutěž |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích |
SGA0201700001 - Veřejná soutěž (GA0/GA) |
| Cíle řešení v původním jazyce |
V r. 2016 jsme identifikovali neobvyklé telomery u rostlin rodu Allium. Společně s našimi předchozími výsledky je nyní jasné, že během evoluce rostlin řádu Asparagales došlo ke dvěma změnám telomer: při první, spojené s divergencí rodu Iris, byly typické rostlinné telomery (TTTAGGG)n nahrazeny telomerami (TTAGGG)n typickými pro obratlovce. Ke druhé změně - z (TTAGGG)n na (CTCGGTTATGGG)n - došlo při divergenci rodu Allium. Cílem projektu je objasnit molekulární podstatu těchto tranzicí - změny v RNA podjednotkách telomeráz a v jejich interakcích s katalytickými podjednotkami - a dále zjistit dopad těchto změn na nukleoproteinové složení a na funkci telomer, která závisí hlavně na telomer-vazebných proteinech. RNA-Seq data budou získána z obohacených frakcí telomerázy a z celkového transkriptomu s cílem identifikovat RNA podjednotky telomeráz, resp. kandidátní telomer-vazebné proteiny. Interakce proteinů se současnými a ancestrálními telomerovými DNA budou testovány kvantitativními přístupy. Projekt zlepší chápání strukturně-funkčních vztahů telomer a role telomer ve speciaci. |
| Cíle řešení v anglickém jazyce |
In 2016, we identified unusual telomeres in Allium plants. Together with our earliear results, it is clear now that two telomere switches occurred in evolution of Asparagales plant order: in the first, associated with divergence of Iris genus, typical plant telomeres (TTTAGGG)n were replaced with vertebrate-type (TTAGGG)n telomeres. The second switch - from (TTAGGG)n to (CTCGGTTATGGG)n - occurred during divergence of Allium genus. We aim to identify molecular principles of the transitions - changes in telomerase RNA subunits (TRs) and their interactions with catalytic subunits - and evaluate impact of the changes on nucleoprotein composition and functions of telomeres which largely depend on telomere-binding proteins (TBPs). RNA-Seq data will be generated from telomerase-enriched fractions and from whole transcriptomes to identify TRs and TBPs, respectively. Protein interactions with current and ancestral telomere DNA will be tested quantitatively. The project will improve understanding of structure-function relationships in telomeres and role of telomeres in speciation. |
| Klíčová slova v anglickém jazyce |
Telomerase RNA subunit;plant evolution;RNA-Seq;unusual telomeres;transcriptome analysis;DNA-protein interactions |
| Kontrolní číslo stavu projektu v letech |
2017: 190678010 ( v1.0 )
2018: 190686308 ( v1.0 )
2019: 190697038 ( v1.0 )
2020: 190714716 ( v1.0 ) |
| Datum dodání posledního záznamu o projektu |
23.07.2020 |
| Systémové označení dodávky dat |
CEP20-GA0-GA-U/02:1 |