Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Centrální evidence projektů

Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGA16-01137S - Faktory genomové stability u mechu a vyšších rostlin (2016-2018, GA0/GA)

Identifikační kód GA16-01137S
Důvěrnost údajů S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce Faktory genomové stability u mechu a vyšších rostlin
Název projektu anglicky Factors of genome stability in moss and flowering plants
Poskytovatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Program GA - Standardní projekty  (1993 - 2050)
Kategorie VaV ZV - Základní výzkum
Hlavní obor - skupina E - Biovědy
Hlavní obor EB - Genetika a molekulární biologie
Vedlejší obor GE - Šlechtění rostlin
Další vedlejší obor -
Zahájení řešení 01.01.2016
Ukončení řešení 31.12.2018
Datum posledního uvolnění účelové podpory 26.04.2018
Číslo smlouvy 16-01137S
Poslední stav řešení U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
tis. Kč **
Finance projektu
201620172018celkem
Výše podpory z národních zdrojů3 120 000,0031203 157 000,0031573 172 000,0031729 449 000,009449
Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů ***0,0000,0000,0000,000
Ostatní veřejné zdroje financování---545 000,00545
Celkové uznané náklady3 293 000,0032933 338 000,0033383 363 000,0033639 994 000,009994
Typčerpanéčerpanéčerpané

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020

Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »

Druh soutěže VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích SGA0201600001 - Veřejná soutěž (GA0/GA)
Cíle řešení v původním jazyce Nestabilita genomu a oprava DNA jsou aktuálními tématy výzkumu vzhledem k jejich těsnému spojení s procesy patogeneze, senescence, evoluce druhů nebo šlechtění rostlin. Zde navrhujeme komparativní zkoumání faktorů stability genomu u Physcomitrella patens a Arabidopsis thaliana k objasnění zúčastněných kontrolních mechanismů a k jejich rozlišení na specifické a obecné (konzervované mezi těmito evolučně vzdálenými rostlinnými druhy s rozdílnou účinností způsobů opravy zlomů v DNA). K řešení projektu bude využito kombinace molekulárně-biologických nástrojů vyvinutých u obou modelových organismů, včetně dostupných mutant, inovovaných genomických zdrojů, společně s obecnými metodami analýzy DNA-proteinových a protein-proteinových interakcí a dynamiky telomer. Současná zkušenost obou zúčastněných týmů se spoluprací na předchozím projektu, stejně jako znalosti a metodické zkušenosti vytvořené při řešení předchozího projektu budou aplikovány pro dosažení cílů navrženého projektu.
Cíle řešení v anglickém jazyce Genome instability and DNA repair are hot topics in current life science due to their tight association with processes of pathogenesis, senescence, species evolution or plant breeding. Here we propose to perform comparative investigation of factors of genome stability between Physcomitrella patens and Arabidopsis thaliana plants to elucidate underlying surveillance mechanisms and to distinguish between specific and general ones (conserved between these evolutionary distant plant species with contrasting proficiency in DSB repair pathways). Combination of molecular biology tools developed in both model species, including available mutants, updated genomic resources, together with general methods to analyze DNA-protein and protein-protein interactions and telomere dynamics will be applied to project solution. Current experience of both participating teams in collaboration in the previous research project, as well as the expertise and methodology background generated during its solution will be used to address the aims of the proposed project.
Klíčová slova v anglickém jazyce DNA repair;genome stability;chromatin;Physcomitrella;Arabidopsis
Kontrolní číslo stavu projektu v letech 2016: 190585634 ( v1.0 )
2017: 190677203 ( v1.0 )
2018: 190685510 ( v1.0 )
2019: 190702053 ( v1.0 )
Datum dodání posledního záznamu o projektu 12.06.2019
Systémové označení dodávky dat CEP19-GA0-GA-U/01:1

Účastníci projektu

Počet příjemců 2
Počet dalších účastníků projektu 0
Příjemce Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Řešitelprof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 8202575)
Příjemce Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
ŘešitelRNDr. Karel J. Angelis, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3566544)

tis. Kč **
Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady201620172018
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta2 248 000,0022482 248 000,0022482 248 000,002248
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.1 045 000,0010451 090 000,0010901 115 000,001115
Výše podpory z národních zdrojů201620172018
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta2 140 000,0021402 140 000,0021402 140 000,002140
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.980 000,009801 017 000,0010171 032 000,001032
Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů201620172018
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta0,0000,0000,000
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,000
Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce201620172018
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta0,0000,0000,000
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.0,0000,0000,000

** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem 30
Výsledek druhu J RIV/00216224:14110/16:00087934 - Two New Faces of Amifostine: Protector from DNA Damage in Normal Cells and Inhibitor of DNA Repair in Cancer Cells (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14110/16:00087934 - Two New Faces of Amifostine: Protector from DNA Damage in Normal Cells and Inhibitor of DNA Repair in Cancer Cells (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14110/16:00087934 - Two New Faces of Amifostine: Protector from DNA Damage in Normal Cells and Inhibitor of DNA Repair in Cancer Cells (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14310/17:00095492 - What Has Been Seen Cannot Be Unseen - Detecting Auxin In Vivo (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14310/17:00095492 - What Has Been Seen Cannot Be Unseen - Detecting Auxin In Vivo (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14310/18:00101537 - Transgenerational phenotype aggravation in CAF-1 mutants reveals parent-of-origin specific epigenetic inheritance (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14310/19:00107668 - The plant Pontin and Reptin homologues, RuvBL1 and RuvBL2a, colocalize with TERT and TRB proteins in vivo, and participate in telomerase biogenesis (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14310/19:00107668 - The plant Pontin and Reptin homologues, RuvBL1 and RuvBL2a, colocalize with TERT and TRB proteins in vivo, and participate in telomerase biogenesis (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088316 - Identification of Nucleolus-Associated Chromatin Domains Reveals a Role for the Nucleolus in 3D Organization of the A. thaliana Genome (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088316 - Identification of Nucleolus-Associated Chromatin Domains Reveals a Role for the Nucleolus in 3D Organization of the A. thaliana Genome (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088685 - Phenotypic reversion in fas mutants of Arabidopsis thaliana by reintroduction of FAS genes: variable recovery of telomeres with major spatial rearrangements and transcriptional reprogramming of 45S rDNA genes (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088685 - Phenotypic reversion in fas mutants of Arabidopsis thaliana by reintroduction of FAS genes: variable recovery of telomeres with major spatial rearrangements and transcriptional reprogramming of 45S rDNA genes (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088686 - Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/16:00088686 - Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell (2016)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095506 - BAL31-NGS approach for identification of telomeres de novo in large genomes (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095506 - BAL31-NGS approach for identification of telomeres de novo in large genomes (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095507 - Evolutionarily Distant Streptophyta Respond Differently to Genotoxic Stress (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/17:00095507 - Evolutionarily Distant Streptophyta Respond Differently to Genotoxic Stress (2017)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101536 - Visualization of the Nucleolus Using Ethynyl Uridine. (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/18:00101536 - Visualization of the Nucleolus Using Ethynyl Uridine. (2018)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00107607 - Roles of RAD51 and RTEL1 in telomere and rDNA stability in Physcomitrella patens (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00107607 - Roles of RAD51 and RTEL1 in telomere and rDNA stability in Physcomitrella patens (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00107670 - Telomeres in Plants and Humans: Not So Different, Not So Similar (2019)
Výsledek druhu J RIV/00216224:14740/19:00107670 - Telomeres in Plants and Humans: Not So Different, Not So Similar (2019)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/16:00471970 - Two New Faces of Amifostine: Protector from DNA Damage in Normal Cells and Inhibitor of DNA Repair in Cancer Cells (2016)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00476529 - Bridging plant and human radiation response and DNA repair through an in silico approach (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00485767 - Evolutionarily distant streptophyta respond differently to genotoxic stress (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/17:00485825 - What has been seen cannot be unseen-detecting auxin in vivo (2017)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/18:00489222 - Integrating plant and animal biology for the search of novel DNA damage biomarkers (2018)
Výsledek druhu J RIV/61389030:_____/19:00507537 - Roles of RAD51 and RTEL1 in telomere and rDNA stability in Physcomitrella patens (2019)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky Řešení projektu přineslo nové poznatky o úloze proteinů podílejících se na udržování chromatinu ve funkci a struktuře telomer, a značně přispělo k objasnění mechanismů odpovědných za stabilitu genomu. Vynikající úroveň výzkumu je dokumentována množstvím publikací (13 článků) a také kvalitou časopisů (např. Cell Reports, Plant J, New Phytol. atd.).
Vyhledávání ...