| Identifikační kód |
EF16_013/0001777 |
| Důvěrnost údajů |
S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných
informačních systémů včetně mezinárodních |
| Název projektu v původním jazyce |
ELIXIR-CZ: Budování kapacit |
| Název projektu anglicky |
ELIXIR-CZ: Capacity building |
| Poskytovatel |
MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Program |
EF - Operační program výzkum, vývoj, vzdělávání (2014 - 2020) |
| Kategorie VaV |
IF - Infrastruktura výzkumu, vývoje a inovací |
| Hlavní obor - skupina |
E - Biovědy |
| Hlavní obor |
EI - Biotechnologie a bionika |
| Vedlejší obor |
IN - Informatika |
| Další vedlejší obor |
- |
| Zahájení řešení |
01.05.2017 |
| Ukončení řešení |
30.04.2021 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory |
06.09.2020 |
| Číslo smlouvy |
16_013/0001777_01 |
| Poslední stav řešení |
U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR) |
| Finance projektu | 2017 | 2018 | 2019 | 2020 | 2021 | celkem |
|---|
| Výše podpory z národních zdrojů | 3 341 000,003341 | 31 753 000,0031753 | 14 760 473,9514760 | 17 760 138,9117760 | 166 961,01167 | 67 781 573,8767782 | | Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | | Celkové uznané náklady | 3 341 000,003341 | 31 753 000,0031753 | 14 760 473,9514760 | 17 760 138,9117760 | 166 961,01167 | 67 781 573,8767782 | | Typ | čerpané | čerpané | čerpané | čerpané | čerpané | |
** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa
*** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020 |
|
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů »
| Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů | 2017 | 2018 | 2019 | 2020 | 2021 | celkem |
|---|
| Finance | 3 341 000,003341 | 31 753 000,0031753 | 14 760 473,9514760 | 17 760 138,9117760 | 166 961,01167 | 67 781 573,8767782 |
|
| Druh soutěže |
- |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích |
- |
| Cíle řešení v původním jazyce |
Projekt plánuje v ČR vybudovat a rozšířit výpočetní a úložnou infrastrukturu pro ukládání, zpracování a analýzu dat z oblasti věd o živé přírodě. Přímo podporuje rovněž rozvoj vybraných nástrojů a databází, které jsou velmi přínosné pro vědeckou komunitu a které obohacují infrastrukturu o pokročilé a vysoce sofistikované služby. Projekt posílí současnou výpočetní infrastrukturu pořízením a instalací ekvivalentu 200 výpočetních uzlů s vysokou hustotou (2-4 CPU, cca 256 GB RAM) ve trojici clusterů, přidá cca 2 PB úložné kapacity pro komunitu ELIXIR-CZ a rozšíří softwarové portfolio obnovením stávajících a přidáním nových licencí relevantních komerčních softwarových balíků.
Tři výzkumné programy v projektu zvýší možnosti infrastruktury ELIXIR-CZ pomocí (1) nové funkcionality nástroje RepeatExplorer (bioinformatický nástroj pro charakterizaci repetitivních prvků sekvenačních dat nové generace (NGS), který bude rozšířen o schopnost zpracovávat dlouhá sekvenanční čtení, produkované moderními sekvenátory), (2) portálově přístupnou platformu Dolbico pro analýzu strukturně-funkčních vztahů nukleových kyselin a (3) zvýšením kvality biomakromolekulárních struktur v proteinové databance (PDB) vývojem nástrojů pro validaci ligandů (MotveValidator a ValidatorDB) a pro automatickou anotaci sekundární struktury proteinů. Všechny tyto aktivity posílí infrastrukturu ELIXIR-CZ a zvýší její prestiž v mezinárodním prostředí.
Detailní popis cílů je obsažen ve Studii proveditelnosti v kapitolách 3.4, 4 a 5. |
| Cíle řešení v anglickém jazyce |
The project plans to build and expand the computing and storage infrastructure in the Czech Republic for the storage, processing and analysis of data from the field of life sciences. It also directly supports the development of selected tools and databases that are very beneficial to the scientific community and which enrich the infrastructure with advanced and highly sophisticated services. The project strengthens the current computing infrastructure by acquiring and installing the equivalent of 200 high-density computing nodes (2-4 CPUs, approx. 256 GB RAM) in a cluster three, adding about 2 PB storage capacity to the ELIXIR-CZ community, and extending the software portfolio by restoring existing and adding new licensing of relevant commercial software packages.
The three research programs in the project will increase the capabilities of the ELIXIR-CZ infrastructure by using (1) the new functionality of RepeatExplorer (a bioinformatic tool for characterizing repetitive elements of the new generation of sequential data (NGS), which will be enhanced by the ability to process long sequential readings produced by modern sequencers) 2) Portal Accessible Dolbico Platform for Analysis of Structure-Functional Nucleic Acid Relationships and (3) Enhancing the Quality of Biomacromolecular Structures in Protein Database (PDB) by developing ligand validation tools (MotveValidator and ValidatorDB) and for automatic annotation of the secondary protein structure. All these activities will strengthen the ELIXIR-CZ infrastructure and increase its prestige in the international environment.
A detailed description of the objectives is contained in the Feasibility Study in chapters 3.4, 4 and 5. |
| Klíčová slova v anglickém jazyce |
infrastructure;ELIXIR;bioinformatics;tools;life sciences |
| Kontrolní číslo stavu projektu v letech |
2017: 190681230 ( v2.0 )
2018: 190691736 ( v2.0 )
2019: 190698093 ( v1.0 )
2020: 190707384 ( v1.0 )
2021: 190734984 ( v2.0 )
2022: 190735402 ( v1.0 ) |
| Datum dodání posledního záznamu o projektu |
30.06.2022 |
| Systémové označení dodávky dat |
CEP22-MSM-EF-U |