Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledání1QS500040581 - Metalofarmaka, vývoj a mechanismus působení (2005-2009, AV0/1Q)

Identifikační kód	1QS500040581
Důvěrnost údajů	S - Není předmětem státního či obchodního tajemství a data lze v souladu s právními předpisy poskytnout do veřejně přístupných informačních systémů včetně mezinárodních
Název projektu v původním jazyce	Metalofarmaka, vývoj a mechanismus působení
Název projektu anglicky	Metallodrugs, design and mechansim of action
Poskytovatel	AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR )
Program	1Q - Podpora projektů cíleného výzkumu (Národní program výzkumu)  (2005 - 2009)
Kategorie VaV	NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)
Hlavní obor - skupina	F - Lékařské vědy
Hlavní obor	FR - Farmakologie a lékárnická chemie
Vedlejší obor	EB - Genetika a molekulární biologie
Další vedlejší obor	BO - Biofyzika
Zahájení řešení	01.07.2005
Ukončení řešení	31.12.2009
Datum posledního uvolnění účelové podpory	11.03.2009
Číslo smlouvy	1QS500040581
Poslední stav řešení	U - Ukončený (rok ukončení projektu < rok sběru dat, v roce sběru dat již není financován ze SR)
Kčtis. Kč ** Finance projektu 2005 2006 2007 2008 2009 celkem Výše podpory z národních zdrojů 986 000,00986 1 971 000,001971 1 971 000,001971 1 971 000,001971 1 971 000,001971 8 870 000,008870 Výše podpory z veřej. zahraničních zdrojů *** 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Celkové uznané náklady 986 000,00986 1 971 000,001971 1 971 000,001971 1 971 000,001971 1 971 000,001971 8 870 000,008870 Typ čerpané čerpané čerpané čerpané čerpané ** Finance v tisících Kč jsou automaticky zaokrouhleny z částky v jednotkách Kč s přesností na 2 desetinná místa *** Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů je sledována od období sběru 2020
Zobrazit skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů » Skutečně čerpané finance projektu z národních zdrojů 2005 2006 2007 2008 2009 celkem Finance 986 000,00986 1 971 000,001971 1 971 000,001971 1 971 000,001971 1 971 000,001971 8 870 000,008870
Druh soutěže	VS - Veřejná soutěž
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích	SAV02005-CI - Veřejná soutěž (AV0/1Q)
Cíle řešení v původním jazyce	Předmětem řešení tohoto projektu je výzkum cílený na vývoj nových metalofarmak chápaný jako přípravná fáze aplikovaného výzkumu směrovaného na další průmyslový a zdravotnický vývoj. Motivace pro tento výzkum vyplývá z potřeby vytvořit kvalitní teoretickéa metodické zázemí pro vývoj, syntézu a aplikaci nových léčiv proti rakovině odvozených od komplexů kovů. Protinádorová účinnost řady komplexů přechodných kovů je podmíněna jejich schopností poškodit DNA. Specifickým cílem tohoto návrhu je tedy odpovědět na zásadní otázku - může modifikace vazby komplexů kovů k DNA a tímto také modifikace signálních drah modulovat následné procesy v buňce do té míry, že tato modifikace povede k opravdu odlišnému profilu protinádorové aktivity ve srovnání s cytostatikyjiž využívanými v klinické praxi? Jedná se tedy o výzkum, jehož výstupy směřují k využití v průmyslové a zdravotnické činnosti, kdy potenciální budoucí uživatel projevuje předem o výsledky řešení tohoto projektu konkrétní zájem.
Cíle řešení v anglickém jazyce	This project is focused on research aimed at design of new metallodrugs which can be characterized as a preparatory phase of applied research toward subsequent industrial and medical development. The impetus for this research results from the need to create theoretical and methodical background for design, synthesis and application of new anticancer metallodrugs. The anticancer activity of several transition metal-based coordination complexes arises from their ability to damage DNA. Hence, the overall significance of this proposal is to ask the fundamental question - can modification of DNA binding of metal-based compounds and thus cell signaling modulate downstream events such that a genuinely different profile of anticancer activity is seen in comparison to the metal-based antitumor agents already used in the clinic? The outputs of this research can be exploited in industrial and medical activities when the potential user takes concrete interest in the results of this project.
Klíčová slova v anglickém jazyce	platinum; ruthenium; antitumor drugs; DNA; cancer
Kontrolní číslo stavu projektu v letech	2005: 1743805 2006: 33634083 2007: 2631760 2008: 167809641 2009: 69340334 2010: 159138719
Datum dodání posledního záznamu o projektu	15.04.2010
Systémové označení dodávky dat	CEP10-AV0-1Q-U/01:1

Účastníci projektu

Počet příjemců	0
Počet dalších účastníků projektu	1

Další účastník projektu	Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Kčtis. Kč **

Finance účastníků projektuPoznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007, investiční prostředky od roku 2013, prostředky ze zahraničních zdrojů od roku 2020

Celkové uznané náklady	2005	2006	2007	2008	2009
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	1 971 000,001971	1 971 000,001971	1 971 000,001971

Výše podpory z národních zdrojů	2005	2006	2007	2008	2009
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	1 971 000,001971	1 971 000,001971	1 971 000,001971

Výše podpory z veřejných zahraničních zdrojů	2005	2006	2007	2008	2009
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Investiční prostředky z podpory ze státního rozpočtu na účastníka v daném roce	2005	2006	2007	2008	2009
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	0,000	0,000	0,000

Zobrazit skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka »

Skutečně čerpané prostředky z národních zdrojů na účastníka během jednotlivých let	2005	2006	2007	2008	2009
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.	0,000	0,000	1 971 000,001971	1 971 000,001971	1 971 000,001971

Výsledky projektu v RIV

Počet výsledků projektu v RIV celkem	82
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/05:00028508 - Conformation, protein recognition and repair of DNA interstrand and intrastrand cross-links of antitumor trans-[PtCl2(NH3)(thiazole)] (2005)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/08:00024417 - Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine: Electroactive Marker for Probing Accessibility of Tryptophan Residues in Proteins (2008)
Výsledek druhu J	RIV/00216224:14310/08:00024417 - Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine: Electroactive Marker for Probing Accessibility of Tryptophan Residues in Proteins (2008)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/08:00310366 - Geometrical and electronic structure variability of the sugar-phosphate backbone in nucleic acids (2008)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/08:00313367 - General base catalysis for cleavage by the active-site cytosine of the hepatitis delta virus ribozyme: QM/MM calculations establish chemical feasibility (2008)
Výsledek druhu J	RIV/61388963:_____/10:00350506 - Molecular dynamics simulations suggest that RNA three-way junctions can act as flexible RNA structural elements in the ribosome (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/05:00023936 - Conformation, protein recognition and repair of DNA interstrand and intrastrand cross-links of antitumor trans-[PtCl2(NH3)(thiazole)] (2005)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00039015 - Recognition of cisplatin-damaged DNA by p53 protein: Critical role of the p53 C-terminal domain (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00039256 - RNA Kink-turns as molecular elbows: Hydration, cation binding, and large-scale dynamics (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00040252 - Deoxyribonuclease I footprinting reveals different DNA binding modes of bifunctional platinum complexes (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00040259 - Interactions of platinum complexes containing cationic, bicyclic, nonplanar piperidinopiperidine ligands with biological nucleophiles (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00040265 - Cationic nonsymmetric transplatinum complexes with piperidinopiperidine ligands. Preparation, characterization, in vitro cytotoxicity, in vivo toxicity, and anticancer efficacy studies (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00040367 - Cations and hydration in catalytic RNA: Molecular dynamics of the hepatitis delta virus ribozyme (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00040671 - Trapped water molecules are essential to structural dynamics and function of a ribozyme (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00042441 - Mechanism of action of anticancer titanocene derivatives: An insight from quantum chemical calculations (2006)
Výsledek druhu C	RIV/68081707:_____/06:00043324 - Interaction of metal cations with nucleic acids and their building units (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00047381 - Structural characterization, DNA interactions, and cytotoxicity of new transplatin analogues containing one aliphatic and one planar heterocyclic amine ligand (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00048154 - Molecular aspects of antitumor effects of a new platinum(IV) drug (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00048156 - DNA binding mode of ruthenium complexes and relationship to tumor cell toxicity (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00053094 - Molecular dynamics simulations of RNA: An in silico single molecule approach (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/06:00075867 - Transplatin is cytotoxic when photoactivated: Enhanced formation of DNA cross-links (2006)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00080773 - Theoretical study on the structure, stability, and electronic properties of the guanine-Zn-cytosine base pair in M-DNA (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00080803 - 1,2-GG intrastrand cross-link of antitumor dinuclear bifunctional platinum compound with spermidine linker inhibits DNA polymerization more effectively than the cross-link of conventional cisplatin (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00081006 - NMR analysis of duplex d(CGCGATCGCG)2 modified by lambda- and delta-[Ru(bpy)2(m-GHK)]Cl2 and DNA photocleavage study (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00081285 - Mechanism of the formation of DNA-protein cross-links by antitumor cisplatin (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00081560 - Recognition of DNA three-way junctions by metallosupramolecular cylinders: Gel electrophoresis studies (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00081633 - Impact of an extruded nucleotide on cleavage activity and dynamic catalytic core conformation of the hepatitis delta virus ribozyme (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00081998 - The genomic HDV ribozyme utilizes a previously unnoticed U-turn motif to accomplish fast site-specific catalysis (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00082644 - DNA interactions of new cytotoxic tetrafunctional dinuclear platinum complex trans,trans-[{PtCl2(NH3)}2(piperazine)] (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00083868 - Dual triggering of DNA binding and fluorescence via photoactivation of a dinuclear ruthenium(II) arene complex (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00083878 - Raman spectroscopy of DNA modified by intrastrand cross-links of antitumor cisplatin (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00087248 - Elastic properties of ribosomal RNA building blocks: Molecular dynamics of the GTPase-associated center rRNA (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00089963 - Molecular dynamics simulations and their application to four-stranded DNA (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00091784 - Bifunctional amine-tethered ruthenium(II) arene complexes form monofunctional adducts on DNA (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00092222 - Conformation of DNA GG intrastrand cross-link of antitumor oxaliplatin and its enantiomeric analog (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00092256 - Biochemical studies of the thermal effects on DNA modifications by the antitumor cisplatin and their repair (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00093336 - Conformations of flanking bases in HIV-1 RNA DIS kissing complexes studied by molecular dynamics (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/07:00345270 - A potent cytotoxic photoactivated platinum complex (2007)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00305777 - Synthesis, biophysical studies, and antiproliferative activity of platinum(II) complexes having 1,2-bis(aminomethyl)carbobicyclic ligands (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00306732 - Cytotoxicity, mutagenicity, cellular uptake, DNA and glutathione interactions of lipophilic trans-platinum complexes tethered to 1-adamantylamine (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00309197 - DNA binding of dinuclear iron(II) metallosupramolecular cylinders. DNA unwinding and sequence preference (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00309262 - DNA interactions of monofunctional organometallic osmium(II) antitumor complexes in cell-free media (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00309783 - Osmium tetroxide, 2,2?-bipyridine: Electroactive marker for probing accessibility of tryptophan residues in proteins (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00310357 - Conformational transitions of flanking purines in HIV-1 RNA dimerization initiation site kissing complexes studied by charmm explicit solvent molecular dynamics (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00310361 - Binding of mismatch repair protein MutS to mispaired DNA adducts of intercalating ruthenium(II) arene complexes (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00310366 - Geometrical and electronic structure variability of the sugar-phosphate backbone in nucleic acids (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00311290 - Cytotoxicity, cellular uptake, and DNA interactions of new monodentate ruthenium(II) complexes containing terphenyl arenes (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00311879 - Magnetické mikročástice ve spojení s elektrochemickou analýzou jako mnohostranně využitelné nástroje pro analýzu biomolekulárních interakcí (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00313216 - Tautomeric equilibrium, stability, and hydrogen bonding in 2'-deoxyguanosine monophosphate complexed with Mg2+ (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00313367 - General base catalysis for cleavage by the active-site cytosine of the hepatitis delta virus ribozyme: QM/MM calculations establish chemical feasibility (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00318497 - Interaction of dinuclear ruthenium(II) supramolecular cylinders with DNA: sequence-specific binding, unwinding, and photocleavage (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00318533 - Theoretical study on the factors controlling the stability of the borate complexes of ribose, arabinose, lyxose, and xylose (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00318542 - The contrasting chemistry and cancer cell cytotoxicity of bipyridine and bipyridinediol ruthenium(II) arene complexes (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00318566 - Biophysical studies on the stability of DNA intrastrand cross-links of transplatin (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00345276 - Unique properties of DNA interstrand cross-links of antitumor oxaliplatin and the effect of chirality of the carrier ligand (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/08:00373427 - Unique properties of DNA interstrand cross-links of antitumor oxaliplatin and the effect of chirality of the carrier ligand (2008)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00318550 - DNA and glutathione interactions in cell-free media of asymmetric platinum(II) complexes cis- and trans-[PtCl2(isopropylamine)(1-methylimidazole)]: relations to their different antitumor effects (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00320869 - DNA interactions of dinuclear RuII arene antitumor complexes in cell-free media (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00322176 - Investigation of the in vitro metabolism of the analgesic flupirtine (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00322991 - Trans Hoogsteen/sugar edge base pairing in RNA. Structures, energies, and stabilities from quantum chemical calculations (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00327307 - Energetics, conformation, and recognition of DNA duplexes modified by methylated analogues of [PtCl(dien)]+ (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00328255 - DNA adducts of antitumor cisplatin preclude telomeric sequences from forming G quadruplexes (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00329244 - Single stranded loops of quadruplex DNA as key benchmark for testing nucleic acids force fields (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00329490 - Studies of the mechanism of action of platinum(II) complexes with potent cytotoxicity in human cancer cells (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00330100 - Classification and energetics of the base-phosphate interactions in RNA (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00330736 - Factors affecting DNA-DNA interstrand cross-links in the antiparallel 3'-3' sense: A comparison with the 5'-5' directional isomer (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00331446 - Ex situ voltammetry and chronopotentiometry of doxorubicin at a pyrolytic graphite electrode: Redox and catalytic properties and analytical applications (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00332052 - Mechanistic studies of the modulation of cleavage activity of topoisomerase I by DNA adducts of mono- and bi-functional Pt-II complexes (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00333332 - Dependence of A-RNA simulations on the choice of the force field and salt strength (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/09:00343810 - The reduction of doxorubicin at a mercury electrode and monitoring its interaction with DNA using constant current chronopotentiometry (2009)
Výsledek druhu C	RIV/68081707:_____/09:00373247 - Role of DNA repair in antitumour effects of platinum drugs (2009)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00340907 - An RNA molecular switch: Intrinsic flexibility of 23S rRNA helices 40 and 68 5?-UAA/5?-GAN internal loops studied by molecular dynamics methods (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00341004 - Theoretical studies on the intermolecular interactions of potentially primordial base-pair analogues (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00342523 - Selective binding of tumor suppressor p53 protein to topologically constrained DNA: Modulation by intercalative drugs (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00342607 - Determination of the level of DNA modification with cisplatin by catalytic hydrogen evolution at mercury-based electrodes (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00344070 - Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00345016 - Extensive molecular dynamics simulations showing that canonical G8 and protonated A38H+ forms are most consistent with crystal structures of hairpin ribozyme (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00345100 - A label-free electrochemical test for DNA-binding activities of tumor suppressor protein p53 using immunoprecipitation at magnetic beads (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00345370 - Conformation and recognition of DNA modified by a new antitumor dinuclear PtII complex resistant to decomposition by sulfur nucleophiles (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00347184 - Cytotoxicity, cellular uptake, glutathione and DNA interactions of an antitumor large-ring PtII chelate complex incorporating the cis-1,4-diaminocyclohexane carrier ligand (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00347709 - Protonation states of the key active site residues and structural dynamics of the glmS riboswitch as revealed by molecular dynamics (2010)
Výsledek druhu J	RIV/68081707:_____/10:00350506 - Molecular dynamics simulations suggest that RNA three-way junctions can act as flexible RNA structural elements in the ribosome (2010)

Hodnocení dokončeného projektu

Hodnocení výsledků	U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků řešení česky	Pomocí metod molekulární biofyziky byl studován mechanismus protinádorového účinku konvenčních a nových komplexů přechodných kovů zejména platiny a ruthenia. Získané výsledky budou využity při racionálním designu nových protinádorových léků.